More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0016 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0016  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
334 aa  661  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.430522  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0413  protein of unknown function DUF21  65.07 
 
 
333 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2682  hypothetical protein  65.26 
 
 
332 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3541  hypothetical protein  64.16 
 
 
332 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3478  hypothetical protein  64.16 
 
 
332 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3491  hypothetical protein  64.16 
 
 
332 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648386  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05870  CBS domain-containing protein  59.46 
 
 
342 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3861  hypothetical protein  64.95 
 
 
332 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3860  protein of unknown function DUF21  58.54 
 
 
350 aa  341  8e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00358184  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2794  protein of unknown function DUF21  60.24 
 
 
340 aa  337  1e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2950  protein of unknown function DUF21  58.13 
 
 
341 aa  328  8e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1940  protein of unknown function DUF21  54.78 
 
 
336 aa  328  9e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.094391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0446  protein of unknown function DUF21  53.64 
 
 
336 aa  326  4e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1686  CBS  53.61 
 
 
340 aa  322  7e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0319  protein of unknown function DUF21  48.54 
 
 
342 aa  305  8e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000713194  normal  0.0140808 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3114  hypothetical protein  47.6 
 
 
345 aa  274  1e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4666  protein of unknown function DUF21  42.6 
 
 
337 aa  220  2e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0118  hypothetical protein  43.08 
 
 
344 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667221  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1369  hypothetical protein  42.86 
 
 
354 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.791695  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1410  hypothetical protein  42.25 
 
 
354 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.42093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5780  protein of unknown function DUF21  39.71 
 
 
353 aa  201  2e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6908  hypothetical protein  40.92 
 
 
337 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24010  CBS domain-containing protein  38.68 
 
 
358 aa  192  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.864311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0048  hypothetical protein  40.92 
 
 
334 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  36.2 
 
 
353 aa  174  1e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3000  hypothetical protein  38.82 
 
 
355 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.911183  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1953  hypothetical protein  36.22 
 
 
348 aa  167  3e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3095  hypothetical protein  36.2 
 
 
353 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2815  hypothetical protein  36.81 
 
 
351 aa  164  2e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2842  hypothetical protein  36.81 
 
 
351 aa  164  2e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2859  hypothetical protein  36.81 
 
 
351 aa  164  2e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31510  CBS domain-containing protein  36.53 
 
 
346 aa  162  9e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6403  hypothetical protein  34.67 
 
 
335 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1235  protein of unknown function DUF21  35.49 
 
 
346 aa  158  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2719  hypothetical protein  35.4 
 
 
349 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244319  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2765  protein of unknown function DUF21  33.62 
 
 
358 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5678  protein of unknown function DUF21  35.96 
 
 
347 aa  156  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  32.13 
 
 
486 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11869  hypothetical protein  34.56 
 
 
345 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.48462e-11  normal  0.224514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2318  protein of unknown function DUF21  32.76 
 
 
357 aa  153  3e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2642  hypothetical protein  33.14 
 
 
356 aa  154  3e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5345  protein of unknown function DUF21  35.42 
 
 
348 aa  152  6e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1721  protein of unknown function DUF21  33.63 
 
 
357 aa  152  9e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  34.04 
 
 
437 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.33033e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2370  protein of unknown function DUF21  33.43 
 
 
355 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.1834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0913  hypothetical protein  36.94 
 
 
365 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471869  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09600  CBS domain-containing protein  32.73 
 
 
346 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2483  protein of unknown function DUF21  32.58 
 
 
365 aa  147  2e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0507  protein of unknown function DUF21  36.2 
 
 
366 aa  146  4e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2377  protein of unknown function DUF21  34.12 
 
 
356 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.76861e-07 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  29.88 
 
 
442 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  30.18 
 
 
442 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22520  CBS domain-containing protein  34.12 
 
 
351 aa  143  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0313025  normal  0.775283 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  29.88 
 
 
442 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3663  hypothetical protein  32.46 
 
 
346 aa  142  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  39.84 
 
 
474 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  29.88 
 
 
442 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  29.88 
 
 
442 aa  142  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  36.62 
 
 
431 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  29.29 
 
 
442 aa  141  1e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  29.29 
 
 
442 aa  141  1e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  28.99 
 
 
440 aa  141  2e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  28.99 
 
 
442 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  29.29 
 
 
440 aa  139  5e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 
435 aa  139  8e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 
361 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  29.31 
 
 
432 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.765e-36 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  29.64 
 
 
432 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 
361 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  29.64 
 
 
425 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  2.91685e-14 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  29.31 
 
 
432 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07760  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
352 aa  138  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  29.31 
 
 
432 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  28.23 
 
 
444 aa  137  3e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  30 
 
 
446 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0062  protein of unknown function DUF21  31.4 
 
 
346 aa  136  6e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  33.43 
 
 
461 aa  135  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  31.68 
 
 
446 aa  135  1e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  30.18 
 
 
432 aa  135  1e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  32.13 
 
 
450 aa  134  2e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  28.44 
 
 
432 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2961  protein of unknown function DUF21  34.8 
 
 
376 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192256  hitchhiker  0.00460853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  27.49 
 
 
448 aa  132  1e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2484  protein of unknown function DUF21  32.84 
 
 
442 aa  131  2e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  28.44 
 
 
432 aa  131  2e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  24.92 
 
 
443 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  27.27 
 
 
437 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  29.08 
 
 
446 aa  129  5e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  34.43 
 
 
439 aa  129  7e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  26.06 
 
 
435 aa  129  9e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  26.06 
 
 
435 aa  129  9e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  26.06 
 
 
435 aa  129  9e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0921  protein of unknown function DUF21  32.34 
 
 
443 aa  129  9e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  26.06 
 
 
435 aa  129  9e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  27.27 
 
 
446 aa  129  1e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  26.06 
 
 
435 aa  129  1e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  27.51 
 
 
444 aa  127  2e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  26.06 
 
 
435 aa  128  2e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2234  hypothetical protein  31.68 
 
 
443 aa  127  2e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840085  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  26.06 
 
 
435 aa  128  2e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>