60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0008 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  100 
 
 
180 aa  358  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  60.89 
 
 
190 aa  204  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  60.89 
 
 
190 aa  204  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  60.89 
 
 
190 aa  204  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  62.21 
 
 
185 aa  201  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  60.82 
 
 
188 aa  195  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  59.76 
 
 
187 aa  176  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  64.05 
 
 
184 aa  173  1e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  58.45 
 
 
217 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  51.11 
 
 
166 aa  130  7e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  59.2 
 
 
143 aa  126  1e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  42.69 
 
 
185 aa  126  2e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  43.11 
 
 
185 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06889e-13 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  46.97 
 
 
217 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  46.72 
 
 
196 aa  120  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  49.22 
 
 
188 aa  118  4e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  48.74 
 
 
173 aa  118  4e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  48.84 
 
 
273 aa  118  5e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  48.51 
 
 
187 aa  118  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  54.35 
 
 
198 aa  115  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  44.8 
 
 
177 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  40 
 
 
188 aa  113  1e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  45.93 
 
 
196 aa  112  2e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  44.35 
 
 
134 aa  110  1e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  54.92 
 
 
201 aa  109  2e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  1.27236e-08 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  42.31 
 
 
207 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  42.24 
 
 
164 aa  101  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  40.8 
 
 
266 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  47.24 
 
 
171 aa  97.1  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  43.55 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  38.52 
 
 
172 aa  92  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  41.67 
 
 
206 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  34.39 
 
 
179 aa  88.2  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  42.5 
 
 
171 aa  84  1e-15  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  38.3 
 
 
173 aa  76.6  2e-13  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  30.97 
 
 
155 aa  73.6  1e-12  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  32.24 
 
 
156 aa  70.5  1e-11  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  36.89 
 
 
168 aa  65.5  4e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.16141e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  31.91 
 
 
151 aa  63.2  2e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  31.91 
 
 
153 aa  62.8  3e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  28.89 
 
 
152 aa  54.7  7e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  31.91 
 
 
117 aa  53.9  1e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  26.55 
 
 
159 aa  52.8  3e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  33.33 
 
 
160 aa  51.2  7e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  22.83 
 
 
96 aa  47.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  21.51 
 
 
97 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  34.88 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  26.17 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  1.88483e-05 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  21.74 
 
 
97 aa  45.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  26.58 
 
 
300 aa  45.1  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  22.83 
 
 
97 aa  44.7  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0544  hypothetical protein  36.67 
 
 
86 aa  44.7  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.77054e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  31.4 
 
 
169 aa  44.3  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1572  protein of unknown function DUF721  22.97 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1595  protein of unknown function DUF721  22.97 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.215209 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2563  protein of unknown function DUF721  27.27 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4084  hypothetical protein  25.64 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  39.29 
 
 
185 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  30.53 
 
 
105 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2350  hypothetical protein  28.43 
 
 
153 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000367866  normal  0.0123481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>