92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1885 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1885  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
92 aa  183  9e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.528745 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1426  ArsR family transcriptional regulator  62.92 
 
 
91 aa  123  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.134473 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0836  regulatory protein, ArsR  54.02 
 
 
90 aa  102  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0003  regulatory protein, ArsR  39.33 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0002  regulatory protein ArsR  46.38 
 
 
92 aa  73.9  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0660  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410209  normal  0.0250069 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0006  regulatory protein, ArsR  40.96 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0924  regulatory protein ArsR  29.49 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  37.33 
 
 
121 aa  47.4  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  39.39 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  39.39 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4180  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 
230 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0708963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  37.1 
 
 
120 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  37.33 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 
105 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0561  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  32.97 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3096  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465743  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  32 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2796  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 
226 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2420  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 
226 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.544065  normal  0.018861 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4445  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
229 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  36 
 
 
125 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3539  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
146 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.107907  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 
119 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1102  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
304 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3353  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
297 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5180  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5019  ArsR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
224 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  37.31 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  37.31 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  37.97 
 
 
109 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  38.37 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2895  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 
322 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0512058  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0486  hypothetical protein  42.55 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.407371  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  38.81 
 
 
122 aa  40.4  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  31.11 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
119 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
125 aa  40  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1988  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
235 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.433498  hitchhiker  0.000545084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>