More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1819 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  66.95 
 
 
700 aa  837  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  71.94 
 
 
702 aa  1011  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  66.52 
 
 
702 aa  881  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  4.97741e-05 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  100 
 
 
702 aa  1349  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  26.52 
 
 
858 aa  156  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  34.46 
 
 
804 aa  151  4e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  24.63 
 
 
864 aa  137  6e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  23.13 
 
 
693 aa  127  8e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  33.33 
 
 
902 aa  96.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  23.06 
 
 
802 aa  94.4  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  27.16 
 
 
795 aa  90.5  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  26.09 
 
 
993 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  27.03 
 
 
993 aa  89.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  23.22 
 
 
805 aa  88.6  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  29.35 
 
 
924 aa  87  1e-15  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  25.98 
 
 
993 aa  86.7  1e-15  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  36.2 
 
 
895 aa  85.5  3e-15  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  24.29 
 
 
935 aa  85.5  3e-15  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  28.01 
 
 
794 aa  85.1  4e-15  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  25.91 
 
 
1074 aa  84.7  5e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  27.64 
 
 
1061 aa  84  9e-15  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  21.81 
 
 
926 aa  79.7  2e-13  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  26.28 
 
 
790 aa  79.3  2e-13  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  24.54 
 
 
1021 aa  75.5  3e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  34.38 
 
 
890 aa  75.1  4e-12  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  27.9 
 
 
812 aa  74.3  6e-12  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  32.68 
 
 
891 aa  74.3  7e-12  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  23.66 
 
 
1019 aa  74.3  8e-12  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  22.9 
 
 
1125 aa  73.6  1e-11  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  21.27 
 
 
994 aa  72.8  2e-11  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1444  SMC domain-containing protein  26.35 
 
 
795 aa  73.2  2e-11  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.353031  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  22.76 
 
 
1191 aa  72  3e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  29.52 
 
 
1057 aa  68.2  5e-10  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  31.13 
 
 
1038 aa  67.8  6e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  23.27 
 
 
1016 aa  67.4  8e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  22.53 
 
 
891 aa  67.4  1e-09  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.56641e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  28.94 
 
 
1019 aa  66.6  2e-09  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  27.27 
 
 
1171 aa  66.2  2e-09  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  26.38 
 
 
984 aa  65.9  2e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29255  predicted protein  31.53 
 
 
1076 aa  66.2  2e-09  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.170598  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  28.65 
 
 
789 aa  63.5  1e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10415  DNA repair protein Rad18, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05440)  26.67 
 
 
1146 aa  63.2  2e-08  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0107863  hitchhiker  5.00177e-06 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  24.83 
 
 
857 aa  62.8  2e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  22.75 
 
 
483 aa  61.2  5e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  23.65 
 
 
888 aa  61.2  6e-08  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  56.52 
 
 
922 aa  60.5  1e-07  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  23.3 
 
 
813 aa  59.3  2e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  23.03 
 
 
978 aa  59.7  2e-07  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  40 
 
 
377 aa  58.9  3e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  29.52 
 
 
904 aa  58.5  4e-07  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  28.83 
 
 
1020 aa  58.2  5e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  27.32 
 
 
953 aa  57.8  7e-07  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  31.38 
 
 
1020 aa  57.8  7e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  23.93 
 
 
859 aa  56.2  2e-06  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  1.09294e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  27.92 
 
 
852 aa  55.5  3e-06  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.21 
 
 
370 aa  55.5  4e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  27.92 
 
 
852 aa  55.5  4e-06  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  28.23 
 
 
1063 aa  55.5  4e-06  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32662  predicted protein  32.58 
 
 
1060 aa  55.5  4e-06  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.429677 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  20.21 
 
 
950 aa  55.5  4e-06  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  29.86 
 
 
1018 aa  55.1  5e-06  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  3.95857e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  44.29 
 
 
302 aa  55.1  5e-06  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  29.86 
 
 
1018 aa  54.7  5e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  7.99023e-11 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0186  ABC transporter related  40 
 
 
244 aa  55.1  5e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.475038 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  28.07 
 
 
1141 aa  54.7  5e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  3.67062e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  44.29 
 
 
302 aa  55.1  5e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  34.41 
 
 
814 aa  55.1  5e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.66162e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  25.63 
 
 
1003 aa  55.1  5e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  40 
 
 
238 aa  55.1  5e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  23.4 
 
 
859 aa  54.7  6e-06  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  33.33 
 
 
912 aa  54.3  7e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  26.76 
 
 
1188 aa  54.3  8e-06  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 
302 aa  53.9  9e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0257  ATP-binding protein  43.75 
 
 
248 aa  53.5  1e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97314e-05 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0210  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 
248 aa  53.5  1e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.770881  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  27.78 
 
 
1018 aa  53.5  1e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  44.29 
 
 
302 aa  53.9  1e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  32.79 
 
 
299 aa  53.1  2e-05  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2484  ABC transporter related  36.23 
 
 
301 aa  53.1  2e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.013646  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54192  predicted protein  31.87 
 
 
1099 aa  52.8  2e-05  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  26.35 
 
 
922 aa  52.8  2e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  27.03 
 
 
922 aa  53.1  2e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  39.74 
 
 
238 aa  53.1  2e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  46.75 
 
 
243 aa  53.1  2e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  44.16 
 
 
246 aa  52.4  3e-05  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  24 
 
 
987 aa  52.4  3e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0929  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  38.46 
 
 
242 aa  52.4  3e-05  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.285427  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0892  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  38.46 
 
 
242 aa  52.4  3e-05  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.495443  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1000  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  38.46 
 
 
242 aa  52.4  3e-05  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  28.19 
 
 
986 aa  52.4  3e-05  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  23.56 
 
 
784 aa  52.4  3e-05  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  23.38 
 
 
1188 aa  52.4  3e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1642  ABC transporter related  40.58 
 
 
308 aa  52.4  3e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00844741  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  23.38 
 
 
1188 aa  52.4  3e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  33.63 
 
 
225 aa  52  4e-05  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  30.77 
 
 
1013 aa  52  4e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  48.78 
 
 
363 aa  51.6  4e-05  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  26.07 
 
 
1008 aa  52  4e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  22.25 
 
 
1191 aa  52  4e-05  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  39.74 
 
 
237 aa  52  4e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>