More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1762 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  100 
 
 
139 aa  272  1.0000000000000001e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  73.38 
 
 
139 aa  223  6e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  76.64 
 
 
138 aa  223  9e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  69.78 
 
 
139 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  39.23 
 
 
131 aa  92.8  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  42.61 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  41.41 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  37.39 
 
 
128 aa  83.6  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  38.76 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  39.34 
 
 
625 aa  82.8  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  39.83 
 
 
614 aa  82.8  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  40 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  40.52 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  40.65 
 
 
606 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  39.34 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  40.65 
 
 
606 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  37.82 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  39.1 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  38.66 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  41.23 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  42.73 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  41.13 
 
 
606 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  35.83 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  42.15 
 
 
625 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  40.16 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  37.61 
 
 
638 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  38.98 
 
 
615 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  37.61 
 
 
624 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  39.32 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  43.43 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  37.01 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  35.83 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  40.16 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  41.18 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  41.82 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  35.94 
 
 
688 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  37.29 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  37.88 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  36.72 
 
 
688 aa  73.6  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  43.44 
 
 
160 aa  73.6  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  38.53 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  35.59 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  38.14 
 
 
615 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  36.07 
 
 
605 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  38.98 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  38.4 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  39.83 
 
 
615 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  39.66 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  40 
 
 
663 aa  71.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  40.35 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  37.82 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  41.12 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  36.22 
 
 
215 aa  70.5  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 
618 aa  70.5  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  41.53 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  37.61 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  40 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  37.93 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  39.29 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  36.22 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  37.29 
 
 
618 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  32.48 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 
620 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  32.48 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  36.43 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  39.5 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  33.33 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  40.54 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  36.44 
 
 
615 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  34.38 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  40.48 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  36.97 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  38.6 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  39.17 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  39.84 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  43.14 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4227  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.43 
 
 
520 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  40.68 
 
 
615 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  37.27 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  36.29 
 
 
623 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  38.33 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  37.29 
 
 
615 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 
688 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  32.61 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  38.74 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  38.74 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  41.18 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.39 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  35.43 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3837  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.65 
 
 
520 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  38.61 
 
 
622 aa  67  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 
149 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.59 
 
 
615 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  33.61 
 
 
646 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  34.21 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  34.71 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  34.43 
 
 
620 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  34.43 
 
 
620 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  38.64 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  35.59 
 
 
615 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>