200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1721 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1721  ATPase  100 
 
 
518 aa  1016    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0370491  decreased coverage  0.0000123614 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0407  ATPase  87.45 
 
 
520 aa  918    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1101  ATPase  85.74 
 
 
517 aa  900    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1385  ATPase  82.5 
 
 
519 aa  875    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  52.99 
 
 
521 aa  544  1e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0536  ATPase  50.86 
 
 
530 aa  465  1e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1639  Nucleotide binding protein PINc  45.76 
 
 
510 aa  423  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.917649  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1925  ATPase  44.47 
 
 
506 aa  417  9.999999999999999e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  39.73 
 
 
605 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  40.85 
 
 
634 aa  364  2e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1247  ATPase  38.72 
 
 
651 aa  360  5e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0622  PilT protein domain protein  38.93 
 
 
597 aa  355  1e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  39.45 
 
 
630 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  40.16 
 
 
630 aa  352  1e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  39.57 
 
 
630 aa  350  4e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  40.27 
 
 
602 aa  350  4e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  38.98 
 
 
625 aa  348  1e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  38.17 
 
 
633 aa  345  2e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  40.08 
 
 
640 aa  341  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  39.25 
 
 
631 aa  339  7e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  38.75 
 
 
629 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  43.53 
 
 
618 aa  334  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  36.48 
 
 
633 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  36.34 
 
 
631 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  33.75 
 
 
655 aa  265  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  35.89 
 
 
642 aa  263  8e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  33.78 
 
 
658 aa  260  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  32.53 
 
 
671 aa  231  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1811  type II secretion system protein E  30.15 
 
 
318 aa  55.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  30.95 
 
 
428 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  30.95 
 
 
428 aa  54.7  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  30.95 
 
 
428 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1275  Type II secretory pathway/competence component, ATPase  28.46 
 
 
356 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  28.57 
 
 
547 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  28.73 
 
 
468 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  24.78 
 
 
362 aa  52  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0722  type II secretion system protein E  27.96 
 
 
385 aa  51.6  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  24.56 
 
 
515 aa  51.6  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  24.74 
 
 
423 aa  51.2  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  27.38 
 
 
423 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  25.23 
 
 
412 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  24.56 
 
 
521 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1378  type II secretion system protein E  27.61 
 
 
419 aa  51.2  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.361275 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  24.56 
 
 
520 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  24.56 
 
 
520 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  24.56 
 
 
523 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  24.56 
 
 
523 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  24.56 
 
 
520 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  26.51 
 
 
344 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  25.81 
 
 
344 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  24.86 
 
 
344 aa  50.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  23.56 
 
 
478 aa  50.4  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  25.98 
 
 
404 aa  50.4  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3385  type II secretion system protein E  30.71 
 
 
693 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1867  type II secretion system protein E  30.71 
 
 
693 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.383587  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  23.55 
 
 
482 aa  50.4  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  25.78 
 
 
428 aa  50.4  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  23.9 
 
 
445 aa  50.4  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  27.47 
 
 
498 aa  50.1  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  26.17 
 
 
330 aa  49.7  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00952  GSPE-like protein  34.65 
 
 
414 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  0.759947 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  29.32 
 
 
468 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0553  type II secretion system protein E  31.45 
 
 
325 aa  50.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  33.87 
 
 
573 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  24.57 
 
 
469 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  24.89 
 
 
332 aa  49.3  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  23.84 
 
 
374 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  21.26 
 
 
482 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  22.95 
 
 
508 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  29.46 
 
 
553 aa  49.3  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  24.28 
 
 
333 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  35.09 
 
 
573 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1894  type II secretion system protein E  26.19 
 
 
317 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0889  type II secretion system protein  26.9 
 
 
595 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  23.76 
 
 
444 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  23.76 
 
 
444 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0559  type II secretion system protein E  29.5 
 
 
1126 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2313  type II secretion system protein E  29.66 
 
 
316 aa  48.5  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  26.21 
 
 
344 aa  48.5  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  21.05 
 
 
489 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  34.48 
 
 
574 aa  47.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  24.86 
 
 
474 aa  47.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  24.82 
 
 
452 aa  47.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  24.28 
 
 
472 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  24.28 
 
 
472 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  24.24 
 
 
521 aa  47.4  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  27.81 
 
 
510 aa  47.8  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0118  type II secretion system protein E  33.9 
 
 
348 aa  47.4  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0334211  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  22.41 
 
 
482 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  30.08 
 
 
559 aa  47  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0392  putative type II protein secretion system E protein CtsE  31.53 
 
 
504 aa  47.4  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  24.55 
 
 
455 aa  47.4  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  25.98 
 
 
445 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2747  type II secretion system protein E  29.66 
 
 
598 aa  47  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  22.41 
 
 
482 aa  47  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  28.69 
 
 
513 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3413  type II secretion system protein E  29.66 
 
 
598 aa  47  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  23.61 
 
 
332 aa  47  0.0009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  22.73 
 
 
492 aa  47  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  32.76 
 
 
573 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>