60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1687 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  100 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  95.45 
 
 		 264 aa  508  1e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  83.33 
 
 		 265 aa  460  1e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  81.44 
 
 		 266 aa  431  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  40.91 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  36.5 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.84 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.09 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.68 
 
 		 265 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.62 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.79 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.62 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.42 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  30.71 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  31.69 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.03 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.15 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.03 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.1 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.28 
 
 		 268 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.63 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.12 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  28.22 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.81 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.73 
 
 		 266 aa  89.7  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  23.68 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.61 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  26.97 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  26.43 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  25.55 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1027  30S ribosomal protein S1  34.41 
 
 		 563 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000294308  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  33.33 
 
 		 121 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  23.33 
 
 		 320 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  33.7 
 
 		 560 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1308  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 557 aa  46.6  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.302956  hitchhiker  0.0000000365743 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0500  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 557 aa  46.6  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.63 
 
 		 707 aa  45.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  31.71 
 
 		 559 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  31.71 
 
 		 559 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  31.11 
 
 		 559 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  23.17 
 
 		 322 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1750  ribosomal protein S1  31.52 
 
 		 563 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00710774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3642  30S ribosomal protein S1  31.52 
 
 		 563 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0546866  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  32 
 
 		 114 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  32 
 
 		 114 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  32 
 
 		 114 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  32 
 
 		 114 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  32 
 
 		 114 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  32 
 
 		 114 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  32 
 
 		 114 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  32 
 
 		 114 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  32 
 
 		 114 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  32 
 
 		 114 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0964  30S ribosomal protein S1  32 
 
 		 562 aa  42.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  30.59 
 
 		 133 aa  42.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0902  30S ribosomal protein S1  32.93 
 
 		 556 aa  42.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0972  30S ribosomal protein S1  32.93 
 
 		 556 aa  42.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.577662  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  35 
 
 		 811 aa  42  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0956  30S ribosomal protein S1  26.83 
 
 		 573 aa  42.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000014577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  30.95 
 
 		 124 aa  42  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>