33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1683 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  100 
 
 
312 aa  627  1e-179  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  81.73 
 
 
312 aa  523  1e-147  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  77.56 
 
 
312 aa  510  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  72.44 
 
 
312 aa  480  1e-134  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  45.61 
 
 
348 aa  251  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  33.7 
 
 
389 aa  158  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  31.72 
 
 
378 aa  152  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  32.24 
 
 
330 aa  147  2e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  36.84 
 
 
320 aa  141  2e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  44.15 
 
 
404 aa  140  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  30.46 
 
 
374 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  28.61 
 
 
386 aa  128  1e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  29.55 
 
 
390 aa  128  1e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  42.22 
 
 
395 aa  128  1e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  29.08 
 
 
373 aa  128  2e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  37.97 
 
 
391 aa  121  1e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  41.04 
 
 
414 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  29.89 
 
 
388 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  40 
 
 
387 aa  119  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  29.38 
 
 
380 aa  117  2e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  36.9 
 
 
391 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  35.06 
 
 
387 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  29.89 
 
 
392 aa  103  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  26.75 
 
 
364 aa  80.5  3e-14  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  26.13 
 
 
357 aa  79.7  5e-14  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  26.56 
 
 
357 aa  79.7  6e-14  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  26.92 
 
 
363 aa  78.6  1e-13  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  24.92 
 
 
355 aa  75.9  7e-13  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01650  conserved hypothetical protein  31.54 
 
 
429 aa  62  1e-08  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55030  p48 polypeptide of DNA primase  25.64 
 
 
437 aa  53.9  4e-06  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48208  predicted protein  28.1 
 
 
398 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.180067 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41816  predicted protein  28.1 
 
 
398 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.251296 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03033  DNA primase subunit Pri1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09020)  23.65 
 
 
521 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.344659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>