270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1633 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  619  1e-176  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  81.79 
 
 		 311 aa  523  1e-147  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  77.41 
 
 		 314 aa  486  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  76.49 
 
 		 312 aa  480  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  74.42 
 
 		 312 aa  474  1e-133  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  40.78 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  35.28 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  36.04 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  34.84 
 
 		 358 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  36.66 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  34.95 
 
 		 332 aa  152  8e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  33.98 
 
 		 358 aa  149  4e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  30.77 
 
 		 388 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  31.07 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  32.39 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  31.17 
 
 		 324 aa  125  9e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  32.08 
 
 		 322 aa  124  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  32.08 
 
 		 348 aa  123  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  31.08 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  30.52 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  29.47 
 
 		 327 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  31.65 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  29.32 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  29.54 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  31.55 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  31.65 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  30.06 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  31.72 
 
 		 658 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  30.52 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  28.62 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  32.29 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  28.93 
 
 		 407 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  34.54 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  30.94 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  29.9 
 
 		 358 aa  103  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  30.58 
 
 		 365 aa  97.8  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  27.94 
 
 		 343 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  26.53 
 
 		 349 aa  93.6  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  27.35 
 
 		 343 aa  93.2  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  32.26 
 
 		 243 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  35.42 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  29.62 
 
 		 348 aa  90.5  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  26.62 
 
 		 343 aa  89.7  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  29.61 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  25.77 
 
 		 225 aa  67  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  29.58 
 
 		 224 aa  67  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  26.85 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  27.09 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  29.78 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  30.29 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  26.32 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  30.05 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3430  recombinase A  27.73 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1125  recombinase A  27.73 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1196  recombinase A  27.73 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  25.9 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  24.12 
 
 		 379 aa  57  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2747  recombinase A  27.31 
 
 		 357 aa  57  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1126  recombinase A  27.31 
 
 		 357 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  28.57 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02549  recombinase A  28.45 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0990  recA protein  28.45 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000616835  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2822  recombinase A  28.45 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0783343  decreased coverage  0.0000036093 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  25.67 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3138  recombinase A  28.45 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383703 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02514  hypothetical protein  28.45 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302057  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1208  recombinase A  27.31 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3031  recombinase A  28.45 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00473022  hitchhiker  0.000967818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2983  recombinase A  28.45 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0313902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1013  recombinase A  28.45 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.580458  unclonable  0.0000000301114 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2980  recombinase A  28.45 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.200628  decreased coverage  0.0000974758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3015  recombinase A  28.45 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  decreased coverage  0.0000000499102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2948  recombinase A  28.45 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1062  recombinase A  27.31 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3946  recombinase A  28.45 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44116  normal  0.835205 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3178  recombinase A  28.45 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0943419  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  25.95 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2835  recombinase A  28.45 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246819  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  29.44 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  25.65 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0981  recA protein  28.45 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0996  recA protein  28.02 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3240  recombinase A  28.88 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.245303  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3375  recombinase A  29.31 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  23.72 
 
 		 355 aa  55.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0901  recombinase A  29.31 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.741416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3340  recombinase A  27.31 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3269  recombinase A  27.31 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3126  recombinase A  27.31 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1248  recombinase A  27.31 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0841  recombinase A  29.31 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0280148  unclonable  0.0000000182986 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3213  recombinase A  29.11 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.996939  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1046  recombinase A  27.31 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.558521 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03513  recombinase A  25.88 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3117  recombinase A  27.31 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1114  recombinase A  29.11 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002519  RecA protein  25.75 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  28.44 
 
 		 224 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  25.88 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  25.68 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>