More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1581 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1581  inner-membrane translocator  100 
 
 		 363 aa  713    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0590  inner-membrane translocator  71.55 
 
 		 363 aa  540  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.293157  hitchhiker  0.0000778251 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1760  inner-membrane translocator  70.28 
 
 		 361 aa  488  1e-137  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0155295  hitchhiker  0.000793372 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0444  inner-membrane translocator  67.43 
 
 		 359 aa  462  1e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0601  inner-membrane translocator  38.4 
 
 		 349 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0318  inner-membrane translocator  30.75 
 
 		 374 aa  176  6e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.936924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1487  inner-membrane translocator  41.28 
 
 		 307 aa  173  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1803  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 369 aa  171  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.68636 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1578  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 344 aa  150  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0304091  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1505  inner-membrane translocator  31.18 
 
 		 371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0827  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 373 aa  129  6e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1419  inner-membrane translocator  34.16 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0602  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 314 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1183  branched-chain amino acid transport system permease protein  27.58 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0528852  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3087  inner-membrane translocator  28.14 
 
 		 504 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0506  inner-membrane translocator  27.03 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1546  inner-membrane translocator  35.65 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1739  inner-membrane translocator  27.49 
 
 		 449 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1040  inner-membrane translocator  32.02 
 
 		 436 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0637  inner-membrane translocator  28.19 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000477005  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  24.62 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1147  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0613  inner-membrane translocator  31.09 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1978  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  38.36 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.58235  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  31.6 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 372 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1207  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 541 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0120652  normal  0.236247 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2494  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 463 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1276  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 441 aa  99.4  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.521519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 463 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  29.24 
 
 		 454 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0858  inner-membrane translocator  29.11 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  28.01 
 
 		 435 aa  97.8  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0325  inner-membrane translocator  24.13 
 
 		 377 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0332  inner-membrane translocator  25.27 
 
 		 377 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1894  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids  30.52 
 
 		 359 aa  95.9  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0493707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2250  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 464 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571474  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4897  inner-membrane translocator  27.64 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1517  hypothetical protein  30.47 
 
 		 434 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845937  normal  0.47549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3705  inner-membrane translocator  33.73 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 463 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  26.8 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3962  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 295 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876388  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0267  inner-membrane translocator  27.08 
 
 		 357 aa  94.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000311573  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  30.54 
 
 		 318 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1828  inner-membrane translocator  27.49 
 
 		 295 aa  94  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3928  inner-membrane translocator  34.21 
 
 		 446 aa  94  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1113  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 460 aa  93.6  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1724  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.29 
 
 		 459 aa  93.2  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  26.78 
 
 		 399 aa  92.8  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  28.45 
 
 		 470 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 456 aa  92.8  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4883  inner-membrane translocator  29.14 
 
 		 377 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3415  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 295 aa  92.8  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3841  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3375  inner-membrane translocator  29.53 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  28.51 
 
 		 407 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  29.36 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2889  inner-membrane translocator  26.83 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2500  inner-membrane translocator  30.24 
 
 		 407 aa  90.9  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.62609  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3972  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28 
 
 		 428 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.640531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5353  inner-membrane translocator  29.22 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_004310  BR1790  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 		 459 aa  90.5  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.62 
 
 		 428 aa  90.5  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  28.05 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0299  inner-membrane translocator  29.11 
 
 		 357 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658484  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  26.57 
 
 		 423 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  25.83 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  26.57 
 
 		 427 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  26.57 
 
 		 427 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  29.44 
 
 		 317 aa  90.1  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  29.81 
 
 		 353 aa  89.7  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  28.88 
 
 		 415 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2097  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 440 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.877591  normal  0.0148892 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4480  inner-membrane translocator  29.05 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5684  inner-membrane translocator  28.45 
 
 		 477 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2473  inner-membrane translocator  29.73 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  28.51 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3000  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.463363  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0678  inner-membrane translocator  29.82 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2554  inner-membrane translocator  27.83 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3390  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.635342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5537  inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1135  inner-membrane translocator  29.22 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  26.86 
 
 		 352 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  27.64 
 
 		 407 aa  87  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2396  inner-membrane translocator  29.74 
 
 		 461 aa  86.7  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00825655 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0100  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.2 
 
 		 424 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0612  inner-membrane translocator  28.23 
 
 		 347 aa  86.3  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  27.09 
 
 		 337 aa  85.9  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2550  inner-membrane translocator  28.96 
 
 		 370 aa  85.9  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 		 307 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2306  inner-membrane translocator  28.27 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3967  inner-membrane translocator  27.46 
 
 		 322 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1608  inner-membrane translocator  24.93 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0142848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  28.33 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3157  inner-membrane translocator  25.76 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.849677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1746  inner-membrane translocator  27.68 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>