More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1519 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  86.84 
 
 
433 aa  753    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  86.68 
 
 
431 aa  760    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  100 
 
 
433 aa  856    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  87.99 
 
 
433 aa  779    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  52.76 
 
 
449 aa  458  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  49.66 
 
 
431 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.65 
 
 
446 aa  379  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  45.78 
 
 
447 aa  366  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  42.3 
 
 
450 aa  360  2e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  42.89 
 
 
450 aa  359  6e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  42.07 
 
 
450 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  42.72 
 
 
444 aa  344  1e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  40.94 
 
 
450 aa  338  8e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  39.91 
 
 
439 aa  338  8e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  42.07 
 
 
450 aa  338  9e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  42.82 
 
 
449 aa  338  9.999999999999999e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  40.28 
 
 
443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  42.82 
 
 
442 aa  325  7e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  42.44 
 
 
443 aa  325  1e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  41.74 
 
 
446 aa  323  3e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  41.69 
 
 
437 aa  320  3e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  39.67 
 
 
464 aa  320  3e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  40 
 
 
468 aa  318  9e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  40.85 
 
 
469 aa  318  1e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  39.86 
 
 
440 aa  311  1e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  39.44 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  40.71 
 
 
441 aa  307  3e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.76 
 
 
464 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  39.49 
 
 
479 aa  293  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  38.85 
 
 
444 aa  292  9e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  37.5 
 
 
518 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  38.71 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  39.17 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  38.69 
 
 
443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  37.47 
 
 
492 aa  281  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  39.95 
 
 
447 aa  280  3e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.85 
 
 
490 aa  280  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  38.69 
 
 
469 aa  279  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  36.55 
 
 
508 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  37 
 
 
439 aa  276  5e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.66 
 
 
447 aa  275  9e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  37.03 
 
 
446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  37.7 
 
 
443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.67 
 
 
481 aa  273  3e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  37.5 
 
 
512 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.7 
 
 
443 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.96 
 
 
446 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.56 
 
 
512 aa  272  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  37.7 
 
 
449 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  40 
 
 
445 aa  271  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  39.05 
 
 
435 aa  271  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  37.77 
 
 
446 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0296  signal recognition particle protein  37.12 
 
 
435 aa  271  1e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130095  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  34.44 
 
 
561 aa  271  2e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  36.68 
 
 
485 aa  270  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  40.96 
 
 
436 aa  269  7e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  39.39 
 
 
492 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  39.39 
 
 
492 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.88 
 
 
447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  37.84 
 
 
441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  35.85 
 
 
521 aa  266  4e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  36.34 
 
 
493 aa  266  5e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.2 
 
 
470 aa  266  7e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  36.36 
 
 
449 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  36.36 
 
 
449 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  36.36 
 
 
449 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  36.36 
 
 
449 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  36.98 
 
 
444 aa  265  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  36.36 
 
 
449 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2535  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.6 
 
 
483 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00293209  normal  0.012093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0376  signal recognition particle protein  37.22 
 
 
455 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751942 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  37.38 
 
 
453 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  37.53 
 
 
456 aa  264  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  36.13 
 
 
449 aa  263  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.33 
 
 
496 aa  264  3e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1202  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54) / transcription elongation factor GreB  37.56 
 
 
495 aa  264  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0352571  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  36.13 
 
 
449 aa  263  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  36.83 
 
 
449 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  35.6 
 
 
455 aa  263  4.999999999999999e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39979  IISP family transporter: signal recognition particle protein (SRP54)  36.61 
 
 
498 aa  263  4.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  36.03 
 
 
476 aa  263  4.999999999999999e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  36.13 
 
 
449 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  36.13 
 
 
449 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.13 
 
 
478 aa  263  6e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000697976 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.43 
 
 
551 aa  263  6e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.15 
 
 
452 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  35.9 
 
 
449 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  37.13 
 
 
522 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  36.05 
 
 
444 aa  262  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  34.65 
 
 
450 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  36.55 
 
 
450 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  35.66 
 
 
453 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.3 
 
 
447 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  34.7 
 
 
442 aa  261  2e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  34.44 
 
 
513 aa  260  3e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  36.36 
 
 
444 aa  260  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  35.45 
 
 
455 aa  261  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  35.45 
 
 
455 aa  261  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  38.8 
 
 
452 aa  261  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0853  signal recognition particle protein  37 
 
 
487 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>