More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1503 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.96 
 
 
970 aa  875    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
937 aa  1878    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  81.9 
 
 
928 aa  1546    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  83.28 
 
 
927 aa  1632    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  80.41 
 
 
928 aa  1558    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.87 
 
 
932 aa  626  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  39.39 
 
 
939 aa  620  1e-176  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  39.81 
 
 
955 aa  616  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.63 
 
 
944 aa  617  1e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  38.93 
 
 
946 aa  613  9.999999999999999e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  38.95 
 
 
943 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  39.1 
 
 
954 aa  597  1e-169  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.73 
 
 
972 aa  590  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  36.15 
 
 
898 aa  552  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.96 
 
 
890 aa  551  1e-155  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.92 
 
 
916 aa  552  1e-155  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.73 
 
 
915 aa  544  1e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  36.21 
 
 
903 aa  536  1e-151  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.32 
 
 
916 aa  531  1e-149  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.46 
 
 
903 aa  529  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.16 
 
 
909 aa  529  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.1 
 
 
912 aa  523  1e-147  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.91 
 
 
897 aa  524  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.62 
 
 
926 aa  520  1e-146  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.72 
 
 
905 aa  472  1.0000000000000001e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.8 
 
 
913 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.34 
 
 
913 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.06 
 
 
946 aa  412  1e-113  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  35.43 
 
 
888 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  33.37 
 
 
1688 aa  375  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  31.75 
 
 
875 aa  370  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  33.82 
 
 
873 aa  367  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  32.28 
 
 
870 aa  362  1e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  32.42 
 
 
872 aa  356  1e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  29.87 
 
 
874 aa  330  6e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.77 
 
 
1429 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  29.59 
 
 
874 aa  326  2e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.43 
 
 
933 aa  324  4e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  29.89 
 
 
1435 aa  320  5e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  29.61 
 
 
874 aa  320  6e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  34.32 
 
 
1434 aa  320  7e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.18 
 
 
1426 aa  320  9e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  35.53 
 
 
1388 aa  316  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  32.06 
 
 
922 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.98 
 
 
1476 aa  316  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  31.32 
 
 
915 aa  314  4.999999999999999e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  31.53 
 
 
914 aa  314  5.999999999999999e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  30.24 
 
 
1480 aa  313  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  34.8 
 
 
1448 aa  311  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  34.65 
 
 
1448 aa  311  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.07 
 
 
931 aa  310  5.9999999999999995e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  34.12 
 
 
1504 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  33.54 
 
 
1431 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.67 
 
 
900 aa  306  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.01 
 
 
1510 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.76 
 
 
1412 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.3 
 
 
1534 aa  303  7.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.35 
 
 
1497 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  28.61 
 
 
872 aa  303  8.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  32.08 
 
 
1509 aa  302  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  30.96 
 
 
1544 aa  302  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.66 
 
 
1451 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  32.4 
 
 
1584 aa  301  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  32.34 
 
 
1419 aa  300  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.77 
 
 
1539 aa  300  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.38 
 
 
1561 aa  299  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.99 
 
 
1523 aa  297  7e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.57 
 
 
1480 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  31.36 
 
 
1535 aa  295  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  31.22 
 
 
1523 aa  295  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.22 
 
 
1523 aa  295  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  33.23 
 
 
1506 aa  294  5e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  37.54 
 
 
1599 aa  292  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.05 
 
 
1516 aa  292  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  37.54 
 
 
1598 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  37.54 
 
 
1598 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  31.92 
 
 
1523 aa  291  5.0000000000000004e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.54 
 
 
1598 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.54 
 
 
1700 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.37 
 
 
1626 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.54 
 
 
1598 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.54 
 
 
1598 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  30.48 
 
 
1567 aa  290  7e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  32.19 
 
 
1493 aa  290  8e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.45 
 
 
1502 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  29.37 
 
 
1573 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.12 
 
 
1514 aa  288  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  34 
 
 
1606 aa  288  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.98 
 
 
1517 aa  288  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.98 
 
 
1475 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  31.16 
 
 
941 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.58 
 
 
1518 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  32.1 
 
 
1495 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  35.41 
 
 
1515 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  31.24 
 
 
1549 aa  285  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.51 
 
 
1508 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.58 
 
 
1505 aa  282  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  31.68 
 
 
1513 aa  278  4e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  35.63 
 
 
1534 aa  277  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  28.78 
 
 
1531 aa  276  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>