More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1347 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  85.4 
 
 
453 aa  772    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
453 aa  919    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  82.74 
 
 
453 aa  791    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  82.85 
 
 
452 aa  790    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  49.78 
 
 
459 aa  417  9.999999999999999e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  37.56 
 
 
453 aa  316  4e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  36 
 
 
453 aa  298  2e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  34.57 
 
 
467 aa  187  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  32.21 
 
 
458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  32.35 
 
 
458 aa  176  7e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1413  geranylgeranyl reductase  32.81 
 
 
456 aa  173  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.145276  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 
485 aa  168  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  32.46 
 
 
455 aa  166  9e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2778  geranylgeranyl reductase  31.29 
 
 
471 aa  162  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2954  geranylgeranyl reductase  32.98 
 
 
457 aa  160  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1523  geranylgeranyl reductase  28.97 
 
 
495 aa  151  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545892  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  31.27 
 
 
406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  33.23 
 
 
398 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 
408 aa  138  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  29.81 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  31.47 
 
 
391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  31.41 
 
 
398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  28.09 
 
 
387 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  31.66 
 
 
397 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  30.62 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  29.12 
 
 
402 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  29.79 
 
 
399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  29.18 
 
 
390 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  29.6 
 
 
390 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 
410 aa  110  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 
414 aa  110  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  30.03 
 
 
390 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  30.91 
 
 
457 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.61 
 
 
407 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  26.54 
 
 
391 aa  105  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  28.98 
 
 
405 aa  103  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 
413 aa  96.7  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 
410 aa  95.9  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  29.11 
 
 
365 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.54 
 
 
376 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  29.69 
 
 
434 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.46 
 
 
434 aa  91.3  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  25.74 
 
 
375 aa  89.7  9e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 
402 aa  89.7  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  29.33 
 
 
424 aa  89  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 
348 aa  87.8  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.42 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
411 aa  88.2  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  24.52 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.86 
 
 
418 aa  87.8  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 
423 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  29.92 
 
 
423 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  28.81 
 
 
423 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25.93 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  29.69 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  28.44 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  28.65 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  27.73 
 
 
430 aa  83.2  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  30.75 
 
 
430 aa  83.2  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  28.17 
 
 
440 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.8 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  29.11 
 
 
426 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  30 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 
438 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  27.5 
 
 
431 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  29.95 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  29.95 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 
438 aa  77.4  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.98 
 
 
445 aa  77.4  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  29.92 
 
 
444 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  23.8 
 
 
396 aa  76.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26.39 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25.76 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  26.84 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  25.42 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  28.48 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  27.79 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  27.7 
 
 
431 aa  73.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 
375 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1540  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 
431 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  26.98 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  27.06 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  30.11 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  26.02 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27 
 
 
434 aa  69.7  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 
429 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  25.52 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  26.75 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  24.03 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  24.29 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  24.18 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  24.08 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  24.72 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  25.6 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>