153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1320 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  51.39 
 
 		 794 aa  778    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  84.31 
 
 		 785 aa  1368    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  100 
 
 		 784 aa  1557    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  79.16 
 
 		 783 aa  1252    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  80.13 
 
 		 786 aa  1287    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  46.48 
 
 		 783 aa  686    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  51.64 
 
 		 781 aa  783    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1060  DNA-directed DNA polymerase  30.83 
 
 		 764 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.474491  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  29.33 
 
 		 781 aa  337  5e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  28.43 
 
 		 780 aa  333  5e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  29.28 
 
 		 780 aa  330  9e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  27.39 
 
 		 811 aa  328  3e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  29.21 
 
 		 810 aa  326  1e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  27.88 
 
 		 941 aa  277  4e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  27.46 
 
 		 910 aa  269  1e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  28.21 
 
 		 932 aa  251  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  29.74 
 
 		 812 aa  248  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  29.56 
 
 		 784 aa  247  4.9999999999999997e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  29.47 
 
 		 821 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  28.91 
 
 		 795 aa  245  3e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  28.77 
 
 		 1058 aa  239  2e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  28.25 
 
 		 1070 aa  233  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  29.87 
 
 		 607 aa  232  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  27.12 
 
 		 796 aa  228  3e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  27.33 
 
 		 818 aa  227  7e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  29.39 
 
 		 853 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  27.48 
 
 		 882 aa  217  7e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  27.2 
 
 		 982 aa  217  7e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  28.9 
 
 		 912 aa  212  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  27.71 
 
 		 791 aa  209  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  28.3 
 
 		 854 aa  208  3e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  28.36 
 
 		 816 aa  208  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  27.85 
 
 		 853 aa  208  3e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  27.54 
 
 		 1044 aa  207  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  27.41 
 
 		 854 aa  204  6e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  25.58 
 
 		 871 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  28.86 
 
 		 786 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  28.43 
 
 		 787 aa  197  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  29.02 
 
 		 794 aa  196  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  27.14 
 
 		 929 aa  196  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  28 
 
 		 788 aa  193  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  28.67 
 
 		 788 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  28.36 
 
 		 786 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  28.77 
 
 		 787 aa  191  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  25.95 
 
 		 816 aa  190  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  27.88 
 
 		 792 aa  190  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  25.64 
 
 		 1087 aa  189  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  27.32 
 
 		 793 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  25 
 
 		 877 aa  188  4e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  27.67 
 
 		 786 aa  187  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  26.46 
 
 		 783 aa  187  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  26.46 
 
 		 783 aa  187  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  27.73 
 
 		 787 aa  187  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  26.32 
 
 		 783 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  26.46 
 
 		 783 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  26.46 
 
 		 783 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  26.46 
 
 		 783 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  26.32 
 
 		 783 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  26.32 
 
 		 783 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  25.8 
 
 		 787 aa  185  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  27.54 
 
 		 789 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  25.85 
 
 		 787 aa  184  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  27.83 
 
 		 786 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  26.32 
 
 		 783 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  28.36 
 
 		 835 aa  184  6e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  27.34 
 
 		 795 aa  184  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  27.83 
 
 		 786 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  26.74 
 
 		 789 aa  183  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  28.23 
 
 		 787 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  26.24 
 
 		 786 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  27.52 
 
 		 787 aa  180  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  26.42 
 
 		 783 aa  180  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  26.42 
 
 		 783 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  27.48 
 
 		 788 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  26.42 
 
 		 783 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  26.15 
 
 		 1485 aa  179  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  27.18 
 
 		 794 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  27.18 
 
 		 794 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  26.28 
 
 		 783 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  26.9 
 
 		 794 aa  179  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  27.34 
 
 		 788 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  26.36 
 
 		 820 aa  173  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  24.29 
 
 		 852 aa  172  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6015  DNA polymerase II  27.56 
 
 		 795 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  27.77 
 
 		 790 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  26.79 
 
 		 793 aa  168  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  27.5 
 
 		 791 aa  168  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  26.76 
 
 		 788 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  25.3 
 
 		 818 aa  165  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  25.33 
 
 		 782 aa  165  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  26.78 
 
 		 790 aa  163  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  26.49 
 
 		 807 aa  163  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  25.81 
 
 		 1459 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  26.25 
 
 		 789 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  26.25 
 
 		 789 aa  162  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0609  DNA polymerase II  26.84 
 
 		 790 aa  162  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  26.25 
 
 		 789 aa  162  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  27.96 
 
 		 809 aa  161  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  27.15 
 
 		 990 aa  160  9e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  25 
 
 		 810 aa  160  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>