More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1020 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  100 
 
 
139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  91.18 
 
 
140 aa  247  5e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  79.85 
 
 
146 aa  224  3e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  71.43 
 
 
143 aa  199  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  52.34 
 
 
139 aa  134  5e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  46.62 
 
 
143 aa  118  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  49.63 
 
 
141 aa  117  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 
142 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  49.63 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2356  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 
134 aa  104  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 
144 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 
148 aa  99.4  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 
142 aa  99  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
140 aa  97.1  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.16 
 
 
583 aa  89.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 
136 aa  84  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  46.55 
 
 
424 aa  83.6  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.09 
 
 
577 aa  82.8  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
303 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  34.38 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  32.61 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 
174 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  41.35 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
229 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
302 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  36.09 
 
 
317 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  34.62 
 
 
169 aa  61.6  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
153 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 
341 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 
164 aa  60.8  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 
272 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  34.75 
 
 
258 aa  60.8  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  32.35 
 
 
336 aa  60.5  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  31.9 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
270 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
270 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
270 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  31.01 
 
 
430 aa  57.4  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  36.44 
 
 
292 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01990  ADP-ribose pyrophosphatase  34.78 
 
 
149 aa  57.4  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
268 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  43.88 
 
 
160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  43.88 
 
 
160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  43.88 
 
 
157 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  43.88 
 
 
160 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  43.88 
 
 
160 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  43.88 
 
 
160 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.78 
 
 
315 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
282 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3496  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
299 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  35.05 
 
 
248 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  51.79 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
310 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  34.75 
 
 
160 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
315 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  43.88 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  52.73 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
289 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  40.82 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  37.37 
 
 
145 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
216 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2635  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
536 aa  53.9  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  29.25 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 
194 aa  53.9  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000271  NUDIX hydrolase domain-containing protein  30.77 
 
 
152 aa  53.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  34.67 
 
 
208 aa  53.5  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
322 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
216 aa  52.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 
301 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  34.38 
 
 
365 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  44.62 
 
 
343 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>