More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1008 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
600 aa  1155    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.000236655 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.89 
 
 
602 aa  934    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0406993 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.67 
 
 
600 aa  907    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.219645 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89 
 
 
600 aa  1048    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.147749  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.35 
 
 
732 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.07 
 
 
572 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
564 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
579 aa  181  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.23 
 
 
576 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.82 
 
 
544 aa  156  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.75 
 
 
740 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  27.11 
 
 
741 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  27.11 
 
 
741 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.54 
 
 
551 aa  148  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.18 
 
 
741 aa  147  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.19 
 
 
742 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.92 
 
 
743 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.04 
 
 
569 aa  125  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  28.02 
 
 
587 aa  124  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 
741 aa  123  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
728 aa  118  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.29 
 
 
579 aa  115  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.15 
 
 
543 aa  110  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.21 
 
 
758 aa  109  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.48 
 
 
692 aa  108  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.9 
 
 
557 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  24.86 
 
 
685 aa  105  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.94 
 
 
561 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.9 
 
 
589 aa  105  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35666  normal  0.522128 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.82 
 
 
692 aa  104  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2938  putative transmembrane ABC transporter protein  25.59 
 
 
603 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.880644  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.22 
 
 
692 aa  103  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.85 
 
 
545 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.7 
 
 
559 aa  103  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  27.29 
 
 
564 aa  103  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.75 
 
 
592 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.86 
 
 
545 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.95 
 
 
692 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.62 
 
 
569 aa  101  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.45 
 
 
603 aa  101  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.65 
 
 
603 aa  101  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.569333  normal  0.0423776 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  26.42 
 
 
589 aa  101  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0950  ABC transporter, permease protein  26.42 
 
 
589 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402794  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  26.21 
 
 
589 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.27 
 
 
561 aa  100  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1726  iron, putative  25.73 
 
 
585 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0368916  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26 
 
 
590 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26 
 
 
590 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297205  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.67 
 
 
590 aa  98.6  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167103  normal  0.195265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.51 
 
 
738 aa  98.2  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.79 
 
 
590 aa  98.2  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.67 
 
 
590 aa  97.8  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312998  normal  0.625588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  25.67 
 
 
590 aa  97.8  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.18 
 
 
563 aa  97.8  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1043  ABC transporter, fused inner membrane subunits  26.73 
 
 
589 aa  97.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0498706  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  24.53 
 
 
700 aa  97.4  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.67 
 
 
590 aa  97.4  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.39 
 
 
606 aa  97.1  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.76 
 
 
558 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.98 
 
 
589 aa  95.5  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26 
 
 
563 aa  94.7  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0112  ABC transporter, permease protein  27.15 
 
 
597 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3146  ABC transporter permease  23.78 
 
 
589 aa  94  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1259  ABC transporter, permease protein  23.78 
 
 
589 aa  94  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.78 
 
 
589 aa  94  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  24.05 
 
 
692 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.56 
 
 
575 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.22 
 
 
615 aa  91.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.65 
 
 
550 aa  91.3  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.81 
 
 
554 aa  90.9  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  27.97 
 
 
562 aa  90.5  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.96 
 
 
551 aa  90.5  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 
663 aa  90.1  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.39 
 
 
558 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.58 
 
 
567 aa  88.6  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.85 
 
 
562 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.85 
 
 
562 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193935  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.09 
 
 
547 aa  88.2  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 
550 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.66 
 
 
608 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.22 
 
 
550 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.72 
 
 
550 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.78 
 
 
562 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.01 
 
 
550 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.02 
 
 
536 aa  83.6  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.41 
 
 
634 aa  83.2  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.15 
 
 
544 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  22.38 
 
 
556 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1377  iron ABC transporter permease  26.9 
 
 
570 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300501  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  25.15 
 
 
544 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  22.53 
 
 
556 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.54 
 
 
543 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  22.77 
 
 
572 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.95 
 
 
544 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
289 aa  79.7  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270331  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.57 
 
 
550 aa  79  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.82 
 
 
565 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.086066  normal  0.404722 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0017  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  36.26 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.257053  normal  0.557332 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.57 
 
 
528 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>