More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0949 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
216 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  91.2 
 
 
216 aa  407  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  75 
 
 
216 aa  327  6e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  69.91 
 
 
216 aa  314  8e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.598204 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  37.91 
 
 
208 aa  132  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  38.21 
 
 
210 aa  131  9e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  36.6 
 
 
247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  36.74 
 
 
227 aa  128  6e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  38.3 
 
 
231 aa  121  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  33.48 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  38.56 
 
 
251 aa  115  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  35.37 
 
 
243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  35.37 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  33.91 
 
 
230 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  37.24 
 
 
246 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  35.47 
 
 
213 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  35.47 
 
 
213 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  34.34 
 
 
280 aa  102  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  36.99 
 
 
227 aa  101  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  33.88 
 
 
274 aa  101  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 
202 aa  97.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  34.78 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  34.15 
 
 
234 aa  97.8  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  32.13 
 
 
260 aa  96.7  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  32.75 
 
 
233 aa  96.7  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  36.45 
 
 
202 aa  95.9  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  32.32 
 
 
245 aa  95.9  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  32.61 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  34.7 
 
 
216 aa  94  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  32.5 
 
 
222 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  36.28 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  31.63 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  26.91 
 
 
226 aa  92.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  34.12 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  32.88 
 
 
227 aa  92.4  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  34.91 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  34.12 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  29.26 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  32.46 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  34.4 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  32.88 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  34.4 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  31.31 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  31.5 
 
 
222 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  31.5 
 
 
222 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  31.5 
 
 
222 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  32.1 
 
 
244 aa  89  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  31.16 
 
 
217 aa  88.6  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  31.19 
 
 
222 aa  89  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  35.12 
 
 
205 aa  88.2  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  32.06 
 
 
220 aa  88.2  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  30.08 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  31.88 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  39.75 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  30.97 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  32.94 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  31.5 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  35.12 
 
 
205 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  30.53 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  35.78 
 
 
215 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  30.15 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  32.29 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  31.58 
 
 
215 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  31.5 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  31.5 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 
223 aa  85.9  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  31.5 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  30.13 
 
 
223 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  30.13 
 
 
223 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  30.13 
 
 
223 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  31.09 
 
 
223 aa  85.9  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  29.57 
 
 
245 aa  85.9  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  31.09 
 
 
223 aa  85.9  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  30.13 
 
 
223 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  27.92 
 
 
238 aa  85.5  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  30.13 
 
 
223 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  31.09 
 
 
223 aa  85.9  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  30.09 
 
 
222 aa  85.9  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  45.54 
 
 
244 aa  85.5  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  30.5 
 
 
222 aa  85.1  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  30.87 
 
 
215 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  31.98 
 
 
212 aa  84.7  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  45.53 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  46.15 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  31.67 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  30.39 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  45.79 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  32.74 
 
 
226 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  47.52 
 
 
215 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  32.16 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  30.7 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  35.44 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  43.24 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  30.13 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  30.13 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  30.13 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>