31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0944 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0944  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  944    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000501517 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1070  hypothetical protein  71.14 
 
 		 475 aa  644    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0028  hypothetical protein  81.73 
 
 		 470 aa  676    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0650  hypothetical protein  71.76 
 
 		 467 aa  618  1e-176  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1007  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.256846  decreased coverage  0.000168852 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1168  extracellular solute-binding protein  33.57 
 
 		 516 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.731614  normal  0.0353149 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0248  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 		 511 aa  219  1e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.370696 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0075  extracellular solute-binding protein  33.74 
 
 		 498 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.735503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1808  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 514 aa  192  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52130  periplasmic binding protein  28.71 
 
 		 388 aa  89.7  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3241  phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC, putative  24.32 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.560629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4801  extracellular solute-binding protein  32.04 
 
 		 442 aa  73.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3495  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  0.246878 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4658  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1990  putative regulatory lipoprotein  28.38 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.307134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1485  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0472403  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2751  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  25.22 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2683  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  24.78 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  0.30829 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0644  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  26.67 
 
 		 440 aa  55.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.788627  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2651  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  23.39 
 
 		 407 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0959912  hitchhiker  0.000467532 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4655  putative regulatory lipoprotein  22.54 
 
 		 395 aa  50.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2539  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  23.39 
 
 		 436 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2628  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  23.39 
 
 		 436 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2587  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  23.39 
 
 		 436 aa  50.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1554  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 354 aa  50.1  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.202841  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2968  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.812096 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 322 aa  47  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 378 aa  46.6  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0214  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.39 
 
 		 337 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>