More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0545 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  100 
 
 
234 aa  462  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  73.93 
 
 
234 aa  372  1e-102  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  75.21 
 
 
234 aa  360  1e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  69.66 
 
 
234 aa  345  3e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  56.6 
 
 
234 aa  256  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  53.02 
 
 
234 aa  241  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  54.7 
 
 
251 aa  241  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  48.09 
 
 
239 aa  235  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  48.28 
 
 
236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  52.77 
 
 
234 aa  233  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  47.23 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  48.5 
 
 
236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0614  ABC transporter related  52.79 
 
 
231 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  54.01 
 
 
238 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  53.59 
 
 
238 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  53.59 
 
 
238 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  49.57 
 
 
249 aa  229  3e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  51.69 
 
 
240 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  45.49 
 
 
237 aa  228  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1710  ABC transporter related  50 
 
 
238 aa  228  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  50.43 
 
 
233 aa  228  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  51.5 
 
 
234 aa  227  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  49.15 
 
 
240 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  49.58 
 
 
240 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  46.38 
 
 
244 aa  226  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  50.43 
 
 
233 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 
234 aa  226  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  49.15 
 
 
235 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  47.41 
 
 
234 aa  225  4e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  46.19 
 
 
242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  50 
 
 
234 aa  224  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  50.21 
 
 
234 aa  224  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  48.43 
 
 
234 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  49.57 
 
 
247 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  49.57 
 
 
234 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  48.5 
 
 
236 aa  222  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  50 
 
 
233 aa  222  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.43 
 
 
234 aa  222  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  48.5 
 
 
231 aa  221  4.9999999999999996e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  48.71 
 
 
233 aa  221  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.29 
 
 
235 aa  221  6e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  46.12 
 
 
237 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  52.14 
 
 
240 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 
233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  50.64 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  48.51 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  49.79 
 
 
233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  47.41 
 
 
233 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  46.98 
 
 
234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  47.84 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  47.98 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.28 
 
 
233 aa  218  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  46.98 
 
 
236 aa  218  5e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  44.83 
 
 
235 aa  218  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  48.28 
 
 
233 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.37 
 
 
254 aa  218  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  48.28 
 
 
233 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  48.28 
 
 
233 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  48.28 
 
 
233 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  49.37 
 
 
250 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.71 
 
 
233 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  48.07 
 
 
234 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  50 
 
 
245 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  48.95 
 
 
247 aa  216  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  51.28 
 
 
242 aa  216  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  47.84 
 
 
237 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  47.84 
 
 
242 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.83 
 
 
244 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  50.85 
 
 
234 aa  216  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  47.01 
 
 
235 aa  216  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  46.61 
 
 
240 aa  216  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  47.84 
 
 
237 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  48.07 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  47.84 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  47.03 
 
 
240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 
235 aa  215  4e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.32 
 
 
251 aa  215  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  45.42 
 
 
244 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  46.64 
 
 
234 aa  215  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  48.32 
 
 
251 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  48.32 
 
 
251 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  47.53 
 
 
235 aa  215  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.84 
 
 
247 aa  215  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 
237 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 
237 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 
237 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 
237 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 
237 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1115  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 
231 aa  215  5e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0191  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.16 
 
 
251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148253  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 
233 aa  214  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4057  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.16 
 
 
251 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  47.9 
 
 
252 aa  214  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  47.9 
 
 
252 aa  214  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  50.22 
 
 
233 aa  214  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3616  ABC transporter related  45.92 
 
 
234 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  46.55 
 
 
234 aa  214  8e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  46.98 
 
 
236 aa  214  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  47.21 
 
 
234 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  45.76 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>