80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0499 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  100 
 
 
349 aa  708    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  52.45 
 
 
346 aa  363  3e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1481  hypothetical protein  92.75 
 
 
140 aa  265  7e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2549  SMC domain protein  28.37 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0441079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  21.76 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  23.26 
 
 
356 aa  63.5  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  21.63 
 
 
341 aa  62.8  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2592  hypothetical protein  20.3 
 
 
429 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1457  putative ATPase  23.4 
 
 
347 aa  60.1  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  23.99 
 
 
393 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  24.04 
 
 
361 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  23.03 
 
 
345 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  24.55 
 
 
495 aa  53.9  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  29.51 
 
 
428 aa  52.8  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  22.62 
 
 
386 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2637  putative ATP-binding protein  23.87 
 
 
353 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592528  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  23.26 
 
 
497 aa  50.8  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  21.11 
 
 
440 aa  49.7  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0666  DNA replication and repair protein RecF  23.96 
 
 
333 aa  49.7  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0186794  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.8 
 
 
548 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  33.33 
 
 
391 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  47.92 
 
 
615 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  40.91 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  40.91 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  34.31 
 
 
435 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.7 
 
 
566 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  22.43 
 
 
386 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1472  ATPase-like protein  27.59 
 
 
426 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0862565  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  29.25 
 
 
465 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  32.26 
 
 
394 aa  47  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  24.07 
 
 
323 aa  46.6  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  24.78 
 
 
378 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  26.16 
 
 
496 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0488  ATPase-like protein  20.39 
 
 
350 aa  46.2  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  27.72 
 
 
357 aa  46.2  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  41.67 
 
 
641 aa  46.2  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  32.76 
 
 
371 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.39 
 
 
634 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  29.06 
 
 
398 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  29.57 
 
 
399 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1679  hypothetical protein  23.17 
 
 
351 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3830  hypothetical protein  35.56 
 
 
534 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531313  hitchhiker  0.000259973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4244  hypothetical protein  35.56 
 
 
538 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777185  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1569  ATPase-like protein  24.3 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.768338  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  41.86 
 
 
604 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  20.54 
 
 
362 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1102  hypothetical protein  41.38 
 
 
411 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.89522  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  23.35 
 
 
424 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  27.72 
 
 
464 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  27.47 
 
 
597 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  38.89 
 
 
513 aa  44.7  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  22.09 
 
 
396 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  27.97 
 
 
429 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  26.32 
 
 
398 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  32.04 
 
 
362 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00444  recombination protein F  24.88 
 
 
357 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  21.79 
 
 
378 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  23.01 
 
 
363 aa  43.5  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  28.4 
 
 
276 aa  43.9  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  28.57 
 
 
412 aa  43.1  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0011  recombination protein F  25.12 
 
 
359 aa  43.1  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10983  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  35.23 
 
 
397 aa  43.5  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  34.85 
 
 
226 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  31.43 
 
 
935 aa  43.5  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  35.82 
 
 
595 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  40.48 
 
 
366 aa  43.1  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  29.27 
 
 
356 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  22.25 
 
 
363 aa  43.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  33.33 
 
 
408 aa  43.1  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  32.65 
 
 
399 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  36.96 
 
 
371 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  32.65 
 
 
399 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  30.43 
 
 
397 aa  43.1  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  48.89 
 
 
397 aa  42.7  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  29.06 
 
 
394 aa  42.7  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.59 
 
 
608 aa  42.7  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  22.07 
 
 
367 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002007  DNA recombination and repair protein RecF  30.21 
 
 
359 aa  42.7  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0003677  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  42.86 
 
 
423 aa  42.7  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  22.07 
 
 
367 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>