47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0338 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0338  nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 
302 aa  608  1e-173  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0229236 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  96.36 
 
 
302 aa  568  1e-161  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  58.52 
 
 
277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1445  nitrate reductase, gamma subunit  38.05 
 
 
302 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0248  Nitrate reductase gamma subunit  36.36 
 
 
299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0840  Nitrate reductase gamma subunit  35.93 
 
 
312 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000098802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  28.46 
 
 
220 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  27.32 
 
 
261 aa  57  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  25.5 
 
 
256 aa  53.5  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  24.14 
 
 
249 aa  52.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  23.05 
 
 
333 aa  52.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  25.83 
 
 
262 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  25.1 
 
 
255 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  24.03 
 
 
335 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  22.11 
 
 
332 aa  50.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  24.3 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1758  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  27.42 
 
 
226 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351215  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2312  respiratory nitrate reductase gamma subunit  29.91 
 
 
225 aa  47  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  21.35 
 
 
331 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1762  respiratory nitrate reductase 2 gamma subunit  26.61 
 
 
226 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1581  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  26.61 
 
 
226 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.214627  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2065  respiratory nitrate reductase gamma subunit  29.06 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1695  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  25.81 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.953876 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  28.72 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1697  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  26.61 
 
 
226 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1562  respiratory nitrate reductase gamma subunit  30.17 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.995386 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1379  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.17 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.477496  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1892  respiratory nitrate reductase subunit gamma  30.17 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.644939  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1956  respiratory nitrate reductase subunit gamma  30.17 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817539  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1897  respiratory nitrate reductase subunit gamma  30.17 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.017842  normal  0.804398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2075  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  25 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2182  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.292963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01435  hypothetical protein  25 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2191  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1646  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1549  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  21.72 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01423  nitrate reductase 2 (NRZ), gamma subunit  25 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2880  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.5 
 
 
225 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  21.34 
 
 
233 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1774  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.72 
 
 
225 aa  43.5  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1709  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  27.42 
 
 
226 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.996367  normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1436  respiratory nitrate reductase gamma subunit  22.76 
 
 
254 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0971317 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  22.34 
 
 
334 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.57 
 
 
233 aa  42.4  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1333  respiratory nitrate reductase gamma subunit  29.09 
 
 
225 aa  42.4  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1856  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.35 
 
 
225 aa  42.4  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>