More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0088 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0088  competence damage-inducible protein A  100 
 
 
271 aa  531  1e-150  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.747767  normal  0.181951 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1136  competence damage-inducible protein A  75.28 
 
 
282 aa  428  1e-119  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.00005e-08 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  76.95 
 
 
262 aa  410  1e-113  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  73.21 
 
 
265 aa  398  1e-110  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1376  competence damage-inducible protein A  66.8 
 
 
273 aa  340  2e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255689  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1209  molybdopterin binding domain-containing protein  48.02 
 
 
257 aa  224  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497342  hitchhiker  0.00709222 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2121  competence damage-inducible protein A  45.85 
 
 
272 aa  206  4e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.240966 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1079  molybdopterin binding domain protein  40.39 
 
 
264 aa  185  7e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2409  molybdopterin binding domain-containing protein  38.52 
 
 
275 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  9.22318e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0886  molybdopterin binding domain-containing protein  37.05 
 
 
274 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  5.3068e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  38.66 
 
 
423 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  35.95 
 
 
411 aa  148  1e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  9.39052e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  41.83 
 
 
415 aa  147  2e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1446  molybdopterin binding domain protein  39.45 
 
 
276 aa  146  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00634302  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  34.84 
 
 
372 aa  146  4e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  37.85 
 
 
413 aa  146  4e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3269  molybdopterin binding domain-containing protein  41.59 
 
 
274 aa  141  1e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1991  molybdopterin binding domain-containing protein  35.06 
 
 
272 aa  139  4e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  34.87 
 
 
415 aa  138  8e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  37.21 
 
 
415 aa  138  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.00645e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  40.4 
 
 
420 aa  135  7e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  34.85 
 
 
413 aa  135  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.53424e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  41.86 
 
 
427 aa  134  1e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  41.23 
 
 
401 aa  135  1e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2136  competence-damaged protein  33.69 
 
 
406 aa  134  2e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  38.19 
 
 
393 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  35.85 
 
 
411 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.22375e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  37.76 
 
 
413 aa  132  8e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  36.32 
 
 
414 aa  132  9e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  35.2 
 
 
406 aa  131  1e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  33.33 
 
 
412 aa  131  1e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  39.58 
 
 
420 aa  130  2e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  40.31 
 
 
410 aa  130  2e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  36.45 
 
 
411 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  38.66 
 
 
418 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  32.92 
 
 
412 aa  129  4e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  37.04 
 
 
417 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  37.72 
 
 
414 aa  127  1e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  46.78 
 
 
431 aa  128  1e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  34.54 
 
 
418 aa  127  2e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  34.17 
 
 
415 aa  127  2e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  40.74 
 
 
391 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  35.85 
 
 
420 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.08181e-06  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  41.92 
 
 
408 aa  126  4e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  39.2 
 
 
433 aa  126  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  31.74 
 
 
419 aa  125  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  34.85 
 
 
415 aa  125  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  43.11 
 
 
408 aa  125  8e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  37.5 
 
 
395 aa  125  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  43.87 
 
 
438 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  32.5 
 
 
415 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  36.45 
 
 
416 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  43.11 
 
 
408 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  39.8 
 
 
423 aa  124  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  48.24 
 
 
432 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  41.38 
 
 
437 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  33.5 
 
 
412 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4097  molybdopterin binding domain-containing protein  34.5 
 
 
392 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  35.47 
 
 
416 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  41.15 
 
 
414 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2338  molybdopterin binding domain protein  39.9 
 
 
228 aa  122  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  34.98 
 
 
417 aa  121  1e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  36.36 
 
 
419 aa  121  1e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  33.16 
 
 
401 aa  121  1e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1389  molybdopterin binding domain protein  47.77 
 
 
228 aa  120  2e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  33.01 
 
 
412 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.39407e-05 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  32.84 
 
 
424 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  33.01 
 
 
412 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.79724e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  33.01 
 
 
412 aa  119  4e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.92498e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  33.01 
 
 
412 aa  119  4e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  7.73442e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  33.01 
 
 
412 aa  119  4e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.00501e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  37.5 
 
 
420 aa  119  5e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1711  molybdopterin binding domain protein  46.67 
 
 
231 aa  119  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  33.01 
 
 
412 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  8.63495e-08  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  33.01 
 
 
412 aa  119  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  6.69667e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  43.23 
 
 
423 aa  119  8e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.34 
 
 
424 aa  118  1e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.84 
 
 
431 aa  118  1e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.84 
 
 
424 aa  118  1e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  38.81 
 
 
423 aa  117  2e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  31.25 
 
 
412 aa  117  2e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  5.21176e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0851  competence/damage-inducible protein CinA, putative  32.14 
 
 
382 aa  117  2e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  35.16 
 
 
408 aa  117  2e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.05098e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  32.52 
 
 
412 aa  117  2e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  32.52 
 
 
412 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.84 
 
 
433 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  39.13 
 
 
414 aa  116  4e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.07251e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2392  competence damage-inducible protein A  33.95 
 
 
400 aa  116  4e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3390  competence damage-inducible protein A  33.95 
 
 
400 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2544  competence damage-inducible protein A  33.95 
 
 
400 aa  116  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  39.29 
 
 
443 aa  116  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  34.9 
 
 
425 aa  115  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1409  competence/damage-inducible protein CinA  33.95 
 
 
400 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1400  competence damage-inducible protein A  33.95 
 
 
400 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.105485  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02175  competence damage-inducible protein A  33.95 
 
 
400 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.478286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02134  hypothetical protein  33.95 
 
 
400 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2403  competence damage-inducible protein A  33.95 
 
 
400 aa  115  7e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  35.71 
 
 
413 aa  115  7e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.04385e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  33.47 
 
 
414 aa  115  7e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  36.36 
 
 
408 aa  115  8e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>