19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0079 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0079  50S ribosomal protein L14e  100 
 
 
103 aa  199  1e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.149247 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1127  50S ribosomal protein L14e  87.38 
 
 
103 aa  184  4e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  8.87763e-06 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0088  50S ribosomal protein L14e  84.47 
 
 
103 aa  178  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0053  50S ribosomal protein L14e  83.5 
 
 
103 aa  176  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0158  ribosomal protein L14E  60.78 
 
 
104 aa  131  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.574976  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1371  50S ribosomal protein L14  60 
 
 
96 aa  123  7e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0462  50S ribosomal protein L14e  55.91 
 
 
98 aa  119  1e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0055  50S ribosomal protein L14e  57.95 
 
 
96 aa  118  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1498  50S ribosomal protein L14e  56.41 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1648  50S ribosomal protein L14e  56.41 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.481236  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0266  50S ribosomal protein L14e  55.13 
 
 
77 aa  87.8  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0980  50S ribosomal protein L14e  55.13 
 
 
77 aa  87.8  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1126  50S ribosomal protein L14e  53.85 
 
 
94 aa  85.1  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25577  predicted protein  39.74 
 
 
133 aa  64.3  5e-10  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01166  60S ribosomal protein L6 (AFU_orthologue; AFUA_1G11130)  27.27 
 
 
198 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0217  hypothetical protein  29.63 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.934654 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02260  ribosomal protein, putative  33.73 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34146  predicted protein  28.09 
 
 
199 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.465057  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03060  structural constituent of ribosome, putative  31.67 
 
 
235 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>