43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0077 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
299 aa  596  1e-169  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.17648 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1125  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  71.14 
 
 
298 aa  457  1e-127  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.35949e-05 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0086  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  67.45 
 
 
300 aa  429  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0051  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  70.03 
 
 
297 aa  427  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1645  hypothetical protein  40.85 
 
 
594 aa  65.1  1e-09  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.942552  normal  0.656502 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1179  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.86 
 
 
465 aa  63.9  3e-09  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.200683 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0635  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  32.47 
 
 
612 aa  53.9  3e-06  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1358  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.47 
 
 
612 aa  53.5  5e-06  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3189  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44 
 
 
610 aa  53.1  5e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0148246  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0762  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.21 
 
 
628 aa  51.2  2e-05  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3088  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  31.96 
 
 
579 aa  51.2  2e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.144325  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2988  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, subunit alpha  34.21 
 
 
635 aa  51.6  2e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371879  hitchhiker  0.00474189 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1740  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40 
 
 
578 aa  50.8  3e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0045  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  40.74 
 
 
589 aa  50.4  4e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0266791 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0171  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  40 
 
 
578 aa  50.4  4e-05  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0863  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40 
 
 
578 aa  50.1  5e-05  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0058  indolepyruvate oxidoreductase, subunit  41.51 
 
 
600 aa  49.7  5e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602223  normal  0.513175 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0807  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  40.54 
 
 
589 aa  50.1  5e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0377  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  43.4 
 
 
592 aa  49.7  6e-05  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00182268  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1082  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.35 
 
 
606 aa  49.7  6e-05  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0746897  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0503  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.18 
 
 
590 aa  49.7  6e-05  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.163144  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0935  thiamine pyrophosphate enzyme  50 
 
 
592 aa  49.3  8e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199927  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1588  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.68 
 
 
579 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.776403  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0781  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.27 
 
 
623 aa  48.5  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1318  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.87 
 
 
612 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2358  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  36.99 
 
 
589 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1196  thiamine pyrophosphate enzyme  32.63 
 
 
580 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00107007  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1172  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.35 
 
 
594 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1334  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  40 
 
 
396 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1133  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  33.73 
 
 
601 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.028644  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0964  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  38.33 
 
 
400 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1326  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  33.33 
 
 
498 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137293  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2698  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  35.56 
 
 
587 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0946  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40 
 
 
577 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1506  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  34.83 
 
 
578 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1834  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  29.63 
 
 
1171 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.86 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.04 
 
 
593 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2135  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.96 
 
 
583 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00067173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  26.92 
 
 
381 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  35.53 
 
 
334 aa  42.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3081  Indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  41.38 
 
 
832 aa  42.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1209  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.74 
 
 
223 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>