More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0070 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
305 aa  596  1e-169  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  82.62 
 
 
305 aa  516  1e-145  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  77.38 
 
 
304 aa  463  1e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  80.2 
 
 
302 aa  459  1e-128  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  50.66 
 
 
318 aa  289  3e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  40.73 
 
 
310 aa  166  3e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  29.55 
 
 
306 aa  134  2e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  7.20941e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  34.11 
 
 
289 aa  134  2e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  35.91 
 
 
308 aa  131  1e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  32.27 
 
 
317 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  31.67 
 
 
308 aa  130  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  35.95 
 
 
308 aa  130  4e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  33.11 
 
 
295 aa  127  2e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  35.39 
 
 
308 aa  125  8e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  29.7 
 
 
290 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  34.32 
 
 
315 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  37.88 
 
 
287 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  29.28 
 
 
306 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  29.28 
 
 
306 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  29.28 
 
 
306 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  29.28 
 
 
306 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  29.28 
 
 
306 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  29.39 
 
 
311 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  35.08 
 
 
305 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  33.87 
 
 
304 aa  119  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  33.87 
 
 
310 aa  119  8e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  33.77 
 
 
306 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  33.89 
 
 
297 aa  115  8e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  33.11 
 
 
320 aa  115  9e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  33.11 
 
 
320 aa  115  1e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  36.64 
 
 
303 aa  115  1e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  31.07 
 
 
345 aa  114  2e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  30.2 
 
 
340 aa  114  2e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  26.09 
 
 
298 aa  114  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  35.41 
 
 
314 aa  113  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  34.63 
 
 
312 aa  113  4e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  30.13 
 
 
291 aa  113  4e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  6.9064e-07  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  31.56 
 
 
302 aa  113  4e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  32.13 
 
 
328 aa  112  7e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  35.05 
 
 
315 aa  111  1e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  31.05 
 
 
314 aa  111  2e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  32.95 
 
 
315 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  33.55 
 
 
302 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  32.95 
 
 
315 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  34.29 
 
 
320 aa  110  4e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  32.9 
 
 
302 aa  110  4e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  30.93 
 
 
326 aa  110  4e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  29.41 
 
 
324 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  31.07 
 
 
293 aa  109  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  31.37 
 
 
301 aa  109  7e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  32.49 
 
 
313 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  32.05 
 
 
308 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  33.54 
 
 
302 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  33.89 
 
 
302 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  32.09 
 
 
331 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  29.03 
 
 
304 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  26 
 
 
304 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  26 
 
 
304 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  29.21 
 
 
326 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  33.98 
 
 
295 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  33.23 
 
 
302 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  31.29 
 
 
308 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  31.29 
 
 
308 aa  106  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  35.43 
 
 
308 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  31.05 
 
 
309 aa  106  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  31.29 
 
 
308 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  35.05 
 
 
309 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  34.52 
 
 
309 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  29.39 
 
 
309 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  31.76 
 
 
321 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  29.28 
 
 
299 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  32.46 
 
 
295 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  33.01 
 
 
306 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  32.79 
 
 
310 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  36.1 
 
 
323 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  32.12 
 
 
305 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  30.92 
 
 
327 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  31.3 
 
 
327 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  36.29 
 
 
301 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  29.58 
 
 
307 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  28.9 
 
 
305 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  31.11 
 
 
313 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  31 
 
 
344 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2878  PfkB  33 
 
 
290 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.662908 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  32.35 
 
 
298 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  32.66 
 
 
321 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  28.89 
 
 
317 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  28.15 
 
 
307 aa  103  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  28.63 
 
 
335 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  31.83 
 
 
308 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  27.76 
 
 
308 aa  103  5e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  31.8 
 
 
305 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.69 
 
 
322 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  34.08 
 
 
337 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  34.08 
 
 
337 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  32.8 
 
 
310 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  32.8 
 
 
310 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  30.79 
 
 
307 aa  102  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.50833e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  30.52 
 
 
303 aa  102  8e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  30.07 
 
 
297 aa  102  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.260714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>