More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0061 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0061  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
474 aa  978  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.63624  normal  0.0841758 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  83.51 
 
 
473 aa  842  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0065  cysteinyl-tRNA synthetase  83.54 
 
 
476 aa  846  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1108  cysteinyl-tRNA synthetase  95.98 
 
 
473 aa  954  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.917766  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0825  cysteinyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 
500 aa  572  1e-162  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 
466 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  4.47814e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
465 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.05277e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
487 aa  385  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
476 aa  388  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
476 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  9.06806e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
475 aa  380  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 
478 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
476 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0967  cysteinyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
462 aa  377  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0501799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
478 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
465 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
474 aa  372  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 
460 aa  371  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
476 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.72423e-06  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 
460 aa  371  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
468 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0097  cysteinyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
470 aa  371  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 
488 aa  367  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
477 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.44083e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 
474 aa  363  3e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
468 aa  362  1e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
453 aa  361  1e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  42 
 
 
485 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
472 aa  360  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
455 aa  360  3e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
459 aa  358  1e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
459 aa  358  1e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.05095e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
459 aa  358  1e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.84367e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
457 aa  357  2e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
459 aa  357  2e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.79239e-08  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
466 aa  357  2e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
466 aa  357  4e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
493 aa  356  4e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
457 aa  356  5e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
461 aa  356  6e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  4.06523e-06  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
459 aa  355  8e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.05927e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
485 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
460 aa  355  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
481 aa  354  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
466 aa  353  3e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
485 aa  353  3e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
465 aa  353  3e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
459 aa  353  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.69576e-05  decreased coverage  4.05781e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
461 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.64638e-05  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
485 aa  352  6e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
461 aa  353  6e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  9.73737e-07  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
458 aa  352  6e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
459 aa  351  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.26973e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
460 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
479 aa  350  2e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
470 aa  351  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
466 aa  350  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
465 aa  350  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
461 aa  350  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.2906e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
460 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
485 aa  348  8e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
461 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
460 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
459 aa  347  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  7.06228e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 
479 aa  348  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
460 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
459 aa  347  3e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
469 aa  347  3e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
459 aa  347  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
465 aa  347  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0679  cysteinyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
470 aa  347  4e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
465 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
465 aa  347  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
465 aa  347  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
465 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.57643e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
465 aa  346  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
460 aa  346  6e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 
460 aa  346  6e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  4.55216e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
465 aa  345  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
472 aa  345  1e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
465 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 
470 aa  344  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
459 aa  344  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1831  cysteinyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
469 aa  344  2e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0215074  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
460 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0635  cysteinyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 
457 aa  344  2e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2077  cysteinyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
465 aa  344  2e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
484 aa  344  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  8.45689e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  39 
 
 
485 aa  343  3e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 
493 aa  343  5e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
483 aa  342  6e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
500 aa  342  7e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  3.51954e-08  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
466 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.84516e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
480 aa  341  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
488 aa  341  2e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
478 aa  340  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
459 aa  340  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  2.5745e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
461 aa  340  3e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.39481e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
461 aa  340  3e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
461 aa  340  3e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  5.65226e-07  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>