More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0058 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0058  30S ribosomal protein S2  100 
 
 
206 aa  421  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0190126 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0061  30S ribosomal protein S2  92.75 
 
 
208 aa  401  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.924609  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0027  30S ribosomal protein S2  91.79 
 
 
208 aa  393  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1104  30S ribosomal protein S2  89.86 
 
 
207 aa  391  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2002  30S ribosomal protein S2  69.19 
 
 
215 aa  306  2e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2140  30S ribosomal protein S2  58 
 
 
225 aa  246  2e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  5.0996e-05  hitchhiker  6.67505e-05 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0274  30S ribosomal protein S2  53.77 
 
 
214 aa  244  8e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1047  ribosomal protein S2  58 
 
 
226 aa  242  3e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.269348  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0478  30S ribosomal protein S2  51.63 
 
 
206 aa  201  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2544  ribosomal protein S2  48.65 
 
 
269 aa  189  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1302  ribosomal protein S2  46.73 
 
 
199 aa  189  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.29354  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0430  ribosomal protein S2  47.57 
 
 
263 aa  188  6e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2599  30S ribosomal protein S2  47.03 
 
 
259 aa  186  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2514  30S ribosomal protein S2  47.49 
 
 
267 aa  184  8e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2378  30S ribosomal protein S2  48.11 
 
 
202 aa  184  9e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00361654  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1237  30S ribosomal protein S2  47.8 
 
 
202 aa  182  2e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.161578  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1826  30S ribosomal protein S2  46.89 
 
 
268 aa  182  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2393  30S ribosomal protein S2  46.46 
 
 
214 aa  181  5e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  1.8478e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1810  30S ribosomal protein S2  45.1 
 
 
205 aa  181  6e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1423  30S ribosomal protein S2  43.33 
 
 
247 aa  177  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.017125 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2215  30S ribosomal protein S2  44.61 
 
 
203 aa  176  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0316  30S ribosomal protein S2  42.02 
 
 
207 aa  176  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2892  30S ribosomal protein S2  45.1 
 
 
202 aa  173  1e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00129354  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0907  30S ribosomal protein S2  40.1 
 
 
220 aa  172  2e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0219  30S ribosomal protein S2  40.1 
 
 
221 aa  171  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1693  30S ribosomal protein S2  40.1 
 
 
221 aa  171  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0759  30S ribosomal protein S2  40.1 
 
 
220 aa  170  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.817066  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1524  30S ribosomal protein S2  38.54 
 
 
221 aa  166  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.524219  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13682  predicted protein  41.94 
 
 
220 aa  160  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76999  ribosomal protein S0A  40.11 
 
 
261 aa  150  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937942  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03172  40S ribosomal protein S0 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F8]  40.11 
 
 
293 aa  146  2e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04340  40S ribosomal protein S0, putative  36.99 
 
 
292 aa  135  6e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.220661  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12355  Ribosomal protein Sa, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  33.33 
 
 
290 aa  126  2e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30496  normal  0.113443 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0026  30S ribosomal protein S2  39.36 
 
 
351 aa  66.2  3e-10  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1398  SSU ribosomal protein S2P  24.8 
 
 
306 aa  65.5  5e-10  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  1.84086e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  23.87 
 
 
246 aa  63.9  2e-09  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  1.59372e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  25.68 
 
 
280 aa  63.9  2e-09  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  26.39 
 
 
262 aa  62.8  3e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  25.45 
 
 
264 aa  62.4  4e-09  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  26.11 
 
 
258 aa  62.4  4e-09  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  38.54 
 
 
271 aa  62  5e-09  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1433  30S ribosomal protein S2  24.55 
 
 
251 aa  61.2  9e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0086997 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  41.46 
 
 
271 aa  61.2  9e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  7.78728e-13  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  36 
 
 
256 aa  61.2  1e-08  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  1.52831e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  25.66 
 
 
251 aa  60.8  1e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2860  30S ribosomal protein S2  24.55 
 
 
253 aa  61.2  1e-08  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  23.53 
 
 
262 aa  60.8  1e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  34.91 
 
 
269 aa  60.5  2e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  23.98 
 
 
255 aa  60.5  2e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  3.15088e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  22.27 
 
 
235 aa  60.1  2e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  23.98 
 
 
255 aa  60.5  2e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  4.66794e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  24.37 
 
 
324 aa  60.1  2e-08  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1510  30S ribosomal protein S2  24.09 
 
 
274 aa  60.5  2e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.0221668 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  23.21 
 
 
255 aa  60.1  2e-08  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  3.6372e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  24.11 
 
 
260 aa  59.7  3e-08  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  9.40316e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  35.24 
 
 
255 aa  59.7  3e-08  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  24.44 
 
 
260 aa  59.7  3e-08  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  1.99149e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  24.11 
 
 
262 aa  59.7  3e-08  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  1.19331e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  21.85 
 
 
235 aa  58.9  5e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.68885e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  25 
 
 
243 aa  58.9  5e-08  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  1.58872e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  23.11 
 
 
245 aa  58.9  5e-08  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  2.06427e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  22.46 
 
 
238 aa  58.2  9e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  2.05725e-13  unclonable  1.05333e-08 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  24.34 
 
 
257 aa  57.8  1e-07  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  5.41904e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  23.98 
 
 
233 aa  58.2  1e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  3.75862e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0359  30S ribosomal protein S2  24 
 
 
245 aa  57.8  1e-07  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  3.54346e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  23.64 
 
 
257 aa  57.8  1e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  1.16198e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4743  ribosomal protein S2  38.1 
 
 
277 aa  57  2e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  2.26587e-10  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  22.67 
 
 
245 aa  57  2e-07  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  2.47942e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1210  30S ribosomal protein S2  43.75 
 
 
256 aa  57  2e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  23.87 
 
 
276 aa  57.4  2e-07  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1648  30S ribosomal protein S2  35.29 
 
 
251 aa  56.6  2e-07  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  24.11 
 
 
259 aa  56.2  3e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  3.41164e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1342  30S ribosomal protein S2  44.78 
 
 
247 aa  56.6  3e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298701  normal  0.417524 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3925  30S ribosomal protein S2  24.54 
 
 
263 aa  56.2  3e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1404  30S ribosomal protein S2  44.78 
 
 
247 aa  56.6  3e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2010  30S ribosomal protein S2  34 
 
 
252 aa  56.2  3e-07  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf061  30S ribosomal protein S2  25.2 
 
 
307 aa  56.2  3e-07  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.838903  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1278  30S ribosomal protein S2  44.78 
 
 
247 aa  56.6  3e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235139  normal  0.160579 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  24.66 
 
 
262 aa  56.2  3e-07  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  5.50841e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  24.55 
 
 
255 aa  55.8  4e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  23.53 
 
 
235 aa  56.2  4e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.51826e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  24.55 
 
 
343 aa  55.8  4e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  24.55 
 
 
255 aa  55.8  4e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  23.74 
 
 
301 aa  56.2  4e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  1.23477e-06  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  24.66 
 
 
259 aa  55.8  4e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  24.55 
 
 
314 aa  55.8  5e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  25.62 
 
 
244 aa  55.8  5e-07  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.85332e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  22.64 
 
 
257 aa  55.5  6e-07  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  23.53 
 
 
288 aa  55.5  6e-07  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1343  30S ribosomal protein S2  32.89 
 
 
247 aa  55.5  6e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1534  ribosomal protein S2  32.89 
 
 
247 aa  55.5  6e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  24.55 
 
 
283 aa  55.1  6e-07  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9516  30S ribosomal protein S2  32.94 
 
 
307 aa  55.1  7e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2578  30S ribosomal protein S2  30.85 
 
 
268 aa  55.1  7e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3528  30S ribosomal protein S2  30.85 
 
 
268 aa  55.1  7e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.421739  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  22.62 
 
 
232 aa  55.1  7e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  6.523e-12  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  24.17 
 
 
256 aa  55.1  7e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.26335e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  31.68 
 
 
262 aa  55.1  8e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.93238e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  24.77 
 
 
301 aa  54.7  9e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3726  30S ribosomal protein S2  25.68 
 
 
261 aa  54.3  1e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.361852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>