268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0054 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 
138 aa  271  3e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  75.36 
 
 
137 aa  214  3e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  79.17 
 
 
145 aa  204  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  79.49 
 
 
135 aa  195  1e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  37.29 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  41.18 
 
 
116 aa  82.8  2e-15  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.63512e-07  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
236 aa  81.3  5e-15  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  34.82 
 
 
118 aa  79  2e-14  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  42.86 
 
 
195 aa  78.6  3e-14  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  40.4 
 
 
128 aa  78.2  4e-14  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  2.43706e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  38.83 
 
 
115 aa  77  7e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  39.81 
 
 
125 aa  76.6  1e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  47.87 
 
 
109 aa  75.5  2e-13  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  36.28 
 
 
125 aa  75.1  3e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  36.84 
 
 
263 aa  69.3  2e-11  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  7.62676e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  32.23 
 
 
195 aa  68.2  3e-11  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  38.54 
 
 
114 aa  68.2  3e-11  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  34.78 
 
 
121 aa  68.2  4e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  29.91 
 
 
114 aa  67.8  4e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  29.91 
 
 
114 aa  67.8  4e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  34.31 
 
 
108 aa  67.4  6e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.84024e-05  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  38.3 
 
 
138 aa  65.9  2e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  31.82 
 
 
112 aa  64.7  4e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  4.45767e-05  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  37.23 
 
 
141 aa  64.3  5e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  34.02 
 
 
125 aa  63.2  1e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  30.97 
 
 
115 aa  62.8  1e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  33.03 
 
 
245 aa  62.4  2e-09  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  35.53 
 
 
118 aa  62  3e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  30.39 
 
 
262 aa  61.2  4e-09  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  30.39 
 
 
262 aa  61.2  4e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  28.89 
 
 
134 aa  61.2  5e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  37.23 
 
 
115 aa  60.5  7e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  33.67 
 
 
171 aa  60.5  8e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0230  putative transcriptional regulator, ModE family  31.3 
 
 
117 aa  60.5  8e-09  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  30.36 
 
 
265 aa  60.1  9e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1450  molybdenum-binding protein  29.13 
 
 
111 aa  60.1  1e-08  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  36.96 
 
 
136 aa  59.7  1e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 
125 aa  59.7  1e-08  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  27.64 
 
 
247 aa  60.1  1e-08  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  30 
 
 
115 aa  59.3  2e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  29.17 
 
 
125 aa  58.9  2e-08  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  30.61 
 
 
155 aa  58.5  3e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  34.21 
 
 
123 aa  57.8  5e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  34.21 
 
 
123 aa  57.8  5e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
128 aa  57  8e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  35.56 
 
 
125 aa  57  8e-08  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  35.05 
 
 
242 aa  56.6  1e-07  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  37.08 
 
 
137 aa  56.6  1e-07  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  35.44 
 
 
276 aa  55.8  2e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  34.85 
 
 
115 aa  55.8  2e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  34.02 
 
 
131 aa  55.8  2e-07  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  56.2  2e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  32.18 
 
 
270 aa  55.5  3e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  31.91 
 
 
117 aa  54.7  4e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  29.73 
 
 
270 aa  54.7  4e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  29.9 
 
 
116 aa  54.3  5e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0119  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
334 aa  54.3  5e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625019  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  29.76 
 
 
268 aa  54.3  5e-07  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  8.16631e-08  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  33.67 
 
 
111 aa  54.3  5e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1779  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
95 aa  54.7  5e-07  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  38.16 
 
 
107 aa  53.9  6e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  32.97 
 
 
111 aa  54.3  6e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  30.93 
 
 
127 aa  54.3  6e-07  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  6.61787e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  34.02 
 
 
155 aa  53.9  7e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  30 
 
 
126 aa  53.9  7e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  40.7 
 
 
118 aa  53.9  7e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  30.89 
 
 
177 aa  53.9  7e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  35 
 
 
118 aa  53.9  7e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  32.97 
 
 
129 aa  53.9  7e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  38.1 
 
 
125 aa  53.9  8e-07  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  27.97 
 
 
125 aa  53.9  8e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
134 aa  53.5  1e-06  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  30.95 
 
 
132 aa  52.4  2e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  32.32 
 
 
129 aa  52.8  2e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  31.78 
 
 
269 aa  52.8  2e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  30.59 
 
 
263 aa  52.8  2e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  29 
 
 
263 aa  52.4  2e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  30.59 
 
 
263 aa  52  3e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13050  molybdenum-binding protein  31.73 
 
 
115 aa  52  3e-06  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.803513  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1577  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  37.8 
 
 
369 aa  51.2  4e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  34.48 
 
 
112 aa  51.2  4e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  34.38 
 
 
270 aa  51.2  4e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  32.56 
 
 
125 aa  51.2  5e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
263 aa  50.8  6e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  31.91 
 
 
272 aa  50.8  6e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  37.04 
 
 
139 aa  50.4  8e-06  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
258 aa  50.4  8e-06  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  30.43 
 
 
257 aa  50.4  9e-06  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  32.41 
 
 
107 aa  50.1  9e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
263 aa  49.7  1e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  30 
 
 
263 aa  49.7  1e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  25.24 
 
 
114 aa  49.7  1e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0339  molybdate metabolism transcriptional regulator  45.76 
 
 
358 aa  50.1  1e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1672  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
304 aa  50.1  1e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.551623  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3565  DNA-binding transcriptional activator TdcA  33.71 
 
 
312 aa  49.3  2e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2092  hypothetical protein  30.77 
 
 
366 aa  49.3  2e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1822  molybdate metabolism transcriptional regulator  32.29 
 
 
386 aa  48.9  2e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00250223 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  31.3 
 
 
162 aa  49.3  2e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0938  putative transcriptional regulator, ModE family  34.21 
 
 
132 aa  48.9  2e-05  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0192  Fis family transcriptional regulator  38.57 
 
 
528 aa  48.9  2e-05  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>