164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0052 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  100 
 
 
201 aa  403  1e-112  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  93.53 
 
 
200 aa  380  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  84.58 
 
 
201 aa  356  1e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  81.59 
 
 
202 aa  355  2e-97  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  63.74 
 
 
206 aa  248  5e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  54.55 
 
 
200 aa  189  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  43.94 
 
 
210 aa  168  4e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  43 
 
 
211 aa  155  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  44.81 
 
 
210 aa  151  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  2.69819e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  41.44 
 
 
203 aa  147  7e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  44.26 
 
 
213 aa  146  2e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  42.93 
 
 
217 aa  146  2e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  39.89 
 
 
203 aa  145  4e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  42.08 
 
 
211 aa  143  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  39.44 
 
 
200 aa  143  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  40.56 
 
 
203 aa  142  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  38.97 
 
 
217 aa  141  5e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  44.81 
 
 
209 aa  139  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  40.44 
 
 
219 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  39.66 
 
 
203 aa  137  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  44.81 
 
 
214 aa  137  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  40.44 
 
 
219 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  39.89 
 
 
219 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  40.44 
 
 
219 aa  132  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40.44 
 
 
225 aa  131  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  40.44 
 
 
207 aa  131  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  36.27 
 
 
204 aa  131  7e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  35.98 
 
 
196 aa  122  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  37.84 
 
 
212 aa  122  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  37.02 
 
 
198 aa  120  2e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  38.67 
 
 
243 aa  117  8e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  33.89 
 
 
210 aa  116  2e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  33.52 
 
 
196 aa  103  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  38.12 
 
 
234 aa  101  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  33.86 
 
 
283 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  37.29 
 
 
243 aa  97.8  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  30.61 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  35.96 
 
 
243 aa  95.9  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  36.57 
 
 
237 aa  94.7  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  30.5 
 
 
245 aa  90.5  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  30.81 
 
 
303 aa  87.8  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  29.47 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866002 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  28.5 
 
 
296 aa  87.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  29.57 
 
 
301 aa  87.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  33.15 
 
 
272 aa  87  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  31.07 
 
 
297 aa  86.3  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  30.65 
 
 
197 aa  84.3  1e-15  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  26.78 
 
 
282 aa  84  2e-15  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  27.84 
 
 
246 aa  83.2  2e-15  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  31.16 
 
 
270 aa  83.2  2e-15  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  31.84 
 
 
257 aa  83.2  2e-15  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  32.8 
 
 
259 aa  83.2  3e-15  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  30.15 
 
 
246 aa  82.4  4e-15  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  31.11 
 
 
201 aa  82.4  4e-15  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  32.04 
 
 
267 aa  82  6e-15  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  32.26 
 
 
259 aa  80.9  1e-14  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  32.8 
 
 
259 aa  80.5  1e-14  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  32.37 
 
 
249 aa  79.7  2e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  36.99 
 
 
237 aa  80.1  2e-14  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  28.89 
 
 
264 aa  79.7  3e-14  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  32.57 
 
 
237 aa  79.7  3e-14  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  32.26 
 
 
259 aa  78.2  7e-14  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  27.62 
 
 
232 aa  77  2e-13  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  33.33 
 
 
240 aa  76.6  2e-13  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  31.35 
 
 
250 aa  75.9  4e-13  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  32.28 
 
 
245 aa  75.1  6e-13  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  27.84 
 
 
217 aa  75.1  7e-13  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  32.35 
 
 
240 aa  73.9  1e-12  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  31.58 
 
 
271 aa  74.7  1e-12  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  25.51 
 
 
231 aa  74.3  1e-12  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  32.34 
 
 
249 aa  73.2  2e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  30.81 
 
 
213 aa  73.6  2e-12  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  28.86 
 
 
282 aa  72.8  3e-12  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  30.96 
 
 
263 aa  72.8  4e-12  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  6.16986e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  31.76 
 
 
243 aa  72  5e-12  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  8.39999e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  29.32 
 
 
187 aa  72.4  5e-12  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  27.03 
 
 
261 aa  72  5e-12  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  27.98 
 
 
268 aa  71.6  7e-12  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  32.64 
 
 
199 aa  71.6  8e-12  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  27.48 
 
 
227 aa  70.9  1e-11  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  29.08 
 
 
239 aa  70.9  1e-11  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  32.54 
 
 
271 aa  70.1  2e-11  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  28.06 
 
 
240 aa  69.7  3e-11  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  1.28954e-06  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  33.53 
 
 
243 aa  69.3  4e-11  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  31.52 
 
 
280 aa  69.3  4e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  26.34 
 
 
253 aa  68.9  4e-11  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  29.47 
 
 
250 aa  68.6  7e-11  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  30.77 
 
 
251 aa  67.4  1e-10  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  27.5 
 
 
304 aa  67  2e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  26.18 
 
 
255 aa  67  2e-10  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  25 
 
 
242 aa  67  2e-10  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  26.83 
 
 
290 aa  66.6  2e-10  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  31.18 
 
 
241 aa  66.2  3e-10  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  29.82 
 
 
250 aa  66.2  3e-10  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  28.71 
 
 
288 aa  65.9  4e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  31.25 
 
 
250 aa  65.1  7e-10  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  30.18 
 
 
256 aa  64.7  8e-10  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  30.54 
 
 
251 aa  64.3  1e-09  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  23.93 
 
 
199 aa  63.5  2e-09  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  28.32 
 
 
241 aa  63.9  2e-09  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>