35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0050 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0050  30S ribosomal protein S17e  100 
 
 
71 aa  143  8e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0479934 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0053  30S ribosomal protein S17e  84.51 
 
 
71 aa  127  5e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493826  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1095  30S ribosomal protein S17e  81.69 
 
 
71 aa  121  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0019  30S ribosomal protein S17e  80.28 
 
 
71 aa  120  6e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0460  ribosomal protein S17E-like protein  61.9 
 
 
105 aa  83.2  1e-15  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.160081 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1491  30S ribosomal protein S17e  60.34 
 
 
64 aa  77.4  6e-14  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0349  ribosomal protein S17e  53.03 
 
 
95 aa  77  8e-14  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1030  30S ribosomal protein S17e  53.97 
 
 
63 aa  75.5  3e-13  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.413697  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1598  30S ribosomal protein S17e  53.97 
 
 
63 aa  75.5  3e-13  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0316  30S ribosomal protein S17e  52.38 
 
 
63 aa  74.7  4e-13  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1459  30S ribosomal protein S17e  58.06 
 
 
62 aa  72.8  1e-12  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0909  30S ribosomal protein S17e  51.67 
 
 
63 aa  71.2  4e-12  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.938862  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3917  Ribosomal protein S17E-like protein  60 
 
 
63 aa  71.2  4e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1450  30S ribosomal protein S17e  50.79 
 
 
63 aa  70.1  9e-12  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1889  Ribosomal protein S17E-like protein  54.72 
 
 
64 aa  69.7  1e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0477  30S ribosomal protein S17e  54.84 
 
 
63 aa  68.6  3e-11  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.510307  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2338  30S ribosomal protein S17e  55.77 
 
 
64 aa  68.6  3e-11  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0792439  normal  0.108991 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0034  Ribosomal protein S17e  54.72 
 
 
63 aa  68.6  3e-11  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1246  Ribosomal protein S17e  44.78 
 
 
68 aa  67.8  5e-11  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1226  SSU ribosomal protein S17E  50 
 
 
64 aa  66.2  1e-10  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.711601 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0827  ribosomal protein S17E-like  47.54 
 
 
86 aa  66.2  1e-10  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.942401  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0324  30S ribosomal protein S17e  60.71 
 
 
63 aa  66.6  1e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.382941  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2260  30S ribosomal protein S17e  48.33 
 
 
76 aa  66.2  1e-10  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.252248 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2585  30S ribosomal protein S17e  46.97 
 
 
64 aa  63.9  6e-10  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.140579  normal  0.47256 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1395  30S ribosomal protein S17e  43.55 
 
 
63 aa  62  3e-09  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.407431  normal  0.322807 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0766  30S ribosomal protein S17e  50.94 
 
 
63 aa  61.6  3e-09  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00222665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1149  30S ribosomal protein S17e  49.21 
 
 
64 aa  59.7  1e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0146  30S ribosomal protein S17e  45.76 
 
 
64 aa  59.7  1e-08  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05979  40S ribosomal protein S17, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10300)  46.67 
 
 
139 aa  58.5  3e-08  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31424  Ribosomal protein S17, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  45 
 
 
134 aa  57  8e-08  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00015015  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76215  40S ribosomal protein S17.e.B  45 
 
 
137 aa  56.2  1e-07  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.480741 
 
 
-
 
NC_006686  CND02960  conserved hypothetical protein  43.33 
 
 
143 aa  55.8  2e-07  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.354727  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1262  Ribosomal protein S17e  37.68 
 
 
79 aa  53.5  9e-07  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19314  predicted protein  41.67 
 
 
125 aa  49.7  1e-05  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1430  hypothetical protein  37.29 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>