More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0049 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  100 
 
 
245 aa  487  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  85.71 
 
 
246 aa  429  1e-119  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  83.74 
 
 
246 aa  420  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  84.49 
 
 
244 aa  418  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  66.53 
 
 
255 aa  293  2e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  7.89854e-05 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  54.58 
 
 
248 aa  246  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  53.81 
 
 
238 aa  242  4e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  50 
 
 
238 aa  227  2e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  1.27555e-09  unclonable  4.29528e-07 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  53.11 
 
 
240 aa  218  8e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  52.7 
 
 
240 aa  218  9e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  52.7 
 
 
240 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  51.87 
 
 
240 aa  215  5e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  50.21 
 
 
240 aa  212  5e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  47.26 
 
 
238 aa  210  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  52.19 
 
 
234 aa  207  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  46.47 
 
 
240 aa  204  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  47.68 
 
 
236 aa  199  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  48 
 
 
240 aa  191  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  43.28 
 
 
237 aa  190  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.54303e-15  n/a   
 
 
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  48.44 
 
 
242 aa  189  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  44.73 
 
 
238 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  44.08 
 
 
244 aa  185  6e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  43.46 
 
 
239 aa  181  8e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  45.78 
 
 
240 aa  179  5e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  43.5 
 
 
257 aa  178  9e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  43.67 
 
 
255 aa  177  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  45.98 
 
 
240 aa  176  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  42.68 
 
 
236 aa  173  2e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  3.53713e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  43.57 
 
 
240 aa  170  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.33391 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  40.41 
 
 
254 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  42.45 
 
 
254 aa  160  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  42.45 
 
 
254 aa  160  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.43 
 
 
255 aa  160  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  43.33 
 
 
239 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  37.99 
 
 
279 aa  105  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  2.63643e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  38.55 
 
 
277 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl126  50S ribosomal protein L2  36.61 
 
 
281 aa  97.1  2e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0445797  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0454  50S ribosomal protein L2  36.41 
 
 
274 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000232989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5784  ribosomal protein L2  38.51 
 
 
274 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.091769 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  37.99 
 
 
276 aa  95.9  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  36.41 
 
 
273 aa  95.1  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  33.79 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.95488e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_420  ribosomal protein L2  36.41 
 
 
274 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00663414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  39.34 
 
 
276 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  39.34 
 
 
276 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.04251e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  39.34 
 
 
276 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.00516e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  37.99 
 
 
277 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.90927e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  37.99 
 
 
277 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.99614e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  39.34 
 
 
276 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  5.12601e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  39.34 
 
 
276 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.38046e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  39.34 
 
 
276 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  36.46 
 
 
277 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0477  50S ribosomal protein L2  35.48 
 
 
274 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0481332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  39.34 
 
 
276 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.00839e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  39.34 
 
 
276 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  9.01221e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0037  50S ribosomal protein L2  38.95 
 
 
276 aa  93.6  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00257974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  38.8 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  37.43 
 
 
281 aa  92.8  4e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  37.99 
 
 
281 aa  92.8  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  3.49234e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  36.87 
 
 
276 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5067  50S ribosomal protein L2  38.71 
 
 
277 aa  92.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.828543  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  37.02 
 
 
277 aa  92  8e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  37.7 
 
 
276 aa  92  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.80933e-09  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  37.7 
 
 
276 aa  92  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.49417e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  37.33 
 
 
276 aa  92  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.90971e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  38.55 
 
 
275 aa  91.7  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  37.57 
 
 
277 aa  91.7  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3181  50S ribosomal protein L2  38.71 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  35.75 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  35.87 
 
 
278 aa  90.5  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  3.4721e-28 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  36.69 
 
 
273 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  37.16 
 
 
276 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.87869e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  37.02 
 
 
275 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  38.67 
 
 
287 aa  90.1  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.93877e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  2.91678e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0693  50S ribosomal protein L2  33.18 
 
 
281 aa  90.1  3e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 
273 aa  89.4  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  37.11 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0701  50S ribosomal protein L2  37 
 
 
277 aa  89.7  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  6.26221e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0669  50S ribosomal protein L2  37 
 
 
277 aa  89.7  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.71407e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  37.11 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.01214e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  7.2222e-06  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  36.69 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  3.02361e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.37187e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2298  50S ribosomal protein L2  39.35 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.749096  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.12597e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.57775e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1548  50S ribosomal protein L2  34.5 
 
 
277 aa  89  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0331  50S ribosomal protein L2  32.82 
 
 
272 aa  89  6e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2771  50S ribosomal protein L2  36.32 
 
 
276 aa  89  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00347741  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1959  50S ribosomal protein L2  35.89 
 
 
277 aa  89  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0386068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>