More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0045 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0048  serine hydroxymethyltransferase  81.86 
 
 
429 aa  716  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0014  serine hydroxymethyltransferase  80.61 
 
 
430 aa  716  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1090  serine hydroxymethyltransferase  88.14 
 
 
430 aa  767  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0045  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
430 aa  874  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0231458 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0346  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 
431 aa  516  1e-145  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1611  Glycine hydroxymethyltransferase  51.54 
 
 
433 aa  448  1e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1650  serine hydroxymethyltransferase  50.84 
 
 
431 aa  424  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278355  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0061  Glycine hydroxymethyltransferase  45.52 
 
 
433 aa  357  2e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1046  serine hydroxymethyltransferase  42.89 
 
 
429 aa  337  2e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1793  serine hydroxymethyltransferase  40.97 
 
 
440 aa  313  4e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3351  Glycine hydroxymethyltransferase  42.64 
 
 
445 aa  287  3e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0411175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3925  Glycine hydroxymethyltransferase  40.51 
 
 
417 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  decreased coverage  0.00651172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0929  Glycine hydroxymethyltransferase  37.02 
 
 
440 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.802509  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2079  serine hydroxymethyltransferase  35.28 
 
 
445 aa  237  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.172467  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0271  Glycine hydroxymethyltransferase  37.32 
 
 
358 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  36.86 
 
 
415 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  37.5 
 
 
422 aa  223  3e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  36.86 
 
 
415 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  36.86 
 
 
415 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  36.86 
 
 
415 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  36.86 
 
 
415 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  36.86 
 
 
415 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  36.86 
 
 
415 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  36.86 
 
 
415 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  37.35 
 
 
415 aa  221  2e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  36.62 
 
 
422 aa  221  2e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  37.1 
 
 
415 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  37.1 
 
 
415 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  37.1 
 
 
415 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  35.95 
 
 
411 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  7.28494e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  36.1 
 
 
415 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  36.59 
 
 
417 aa  217  3e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  35.94 
 
 
508 aa  217  3e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  35.87 
 
 
415 aa  215  1e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  37.47 
 
 
415 aa  215  1e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  36.5 
 
 
412 aa  215  1e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  36.36 
 
 
415 aa  214  2e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  36.15 
 
 
413 aa  215  2e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  36.61 
 
 
431 aa  214  3e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  35.81 
 
 
414 aa  214  3e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  4.68931e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  35.81 
 
 
413 aa  213  4e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  3.58223e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  35.81 
 
 
413 aa  213  4e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.15106e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  36.24 
 
 
412 aa  213  5e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  36.43 
 
 
438 aa  213  5e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  36.43 
 
 
439 aa  213  6e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  36.61 
 
 
415 aa  213  6e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  36.61 
 
 
431 aa  213  6e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  35.54 
 
 
414 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  35.54 
 
 
414 aa  213  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  35.54 
 
 
413 aa  213  8e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  35.83 
 
 
413 aa  212  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  35.98 
 
 
413 aa  212  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  5.94889e-09  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  35.54 
 
 
413 aa  212  9e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.29833e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0692  serine hydroxymethyltransferase  34.7 
 
 
421 aa  212  9e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.414357  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  37.6 
 
 
415 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  37.6 
 
 
417 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  36.08 
 
 
417 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  36.08 
 
 
417 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  35.21 
 
 
415 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  37.6 
 
 
415 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  37.43 
 
 
417 aa  211  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  36 
 
 
425 aa  210  3e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  36.08 
 
 
417 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  37.34 
 
 
417 aa  210  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2754  serine hydroxymethyltransferase  36.71 
 
 
415 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  35.82 
 
 
417 aa  210  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  34.96 
 
 
415 aa  210  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  35.28 
 
 
413 aa  210  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.38182e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  36.43 
 
 
438 aa  209  6e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  35.7 
 
 
413 aa  209  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.66706e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  36.08 
 
 
417 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  37.03 
 
 
421 aa  209  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0722  serine hydroxymethyltransferase  34.96 
 
 
436 aa  209  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.142236 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  36.54 
 
 
417 aa  209  8e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0221  serine hydroxymethyltransferase  35.5 
 
 
412 aa  209  9e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  35.88 
 
 
415 aa  209  9e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  36.08 
 
 
417 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  36.08 
 
 
417 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3769  Glycine hydroxymethyltransferase  35.41 
 
 
417 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  0.168004 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  34.77 
 
 
410 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  36.62 
 
 
424 aa  207  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  36.08 
 
 
417 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  35.75 
 
 
437 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  35.57 
 
 
417 aa  207  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  36.46 
 
 
419 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  36.81 
 
 
417 aa  206  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  36.48 
 
 
418 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  35.99 
 
 
413 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0615  Glycine hydroxymethyltransferase  35.02 
 
 
415 aa  206  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0311  serine hydroxymethyltransferase  34.53 
 
 
420 aa  204  2e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  35.94 
 
 
417 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  36.03 
 
 
417 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  35.11 
 
 
414 aa  204  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1626  Glycine hydroxymethyltransferase  36 
 
 
425 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696145  normal  0.61537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  36.01 
 
 
434 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  35.53 
 
 
430 aa  203  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  36.99 
 
 
414 aa  203  6e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  35.86 
 
 
417 aa  202  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  36.76 
 
 
434 aa  202  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0796  serine hydroxymethyltransferase  37.08 
 
 
416 aa  202  8e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>