55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0038 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  100 
 
 
80 aa  163  8e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  96.25 
 
 
80 aa  159  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  95 
 
 
80 aa  158  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  94.94 
 
 
80 aa  156  9e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  53.33 
 
 
79 aa  83.6  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  56.92 
 
 
75 aa  77.8  5e-14  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.133876 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  54.29 
 
 
76 aa  75.5  2e-13  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  50.75 
 
 
73 aa  73.2  1e-12  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  51.72 
 
 
75 aa  69.7  1e-11  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  54.55 
 
 
78 aa  68.2  4e-11  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  49.12 
 
 
80 aa  67.8  5e-11  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  50.88 
 
 
75 aa  67  7e-11  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  52.63 
 
 
76 aa  67  9e-11  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  43.75 
 
 
72 aa  67  9e-11  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  44.44 
 
 
71 aa  64.7  4e-10  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  43.75 
 
 
72 aa  61.6  3e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  44.62 
 
 
75 aa  62  3e-09  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  45.61 
 
 
75 aa  59.3  2e-08  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  46.27 
 
 
100 aa  58.2  4e-08  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  42.19 
 
 
81 aa  55.1  3e-07  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0290  like-Sm ribonucleoprotein core  46.03 
 
 
71 aa  53.9  8e-07  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39384  predicted protein  44.29 
 
 
126 aa  52  3e-06  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.447648  normal  0.30848 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0349  like-Sm ribonucleoprotein core  35.06 
 
 
80 aa  50.4  8e-06  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  41.94 
 
 
88 aa  50.4  8e-06  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  43.94 
 
 
87 aa  50.1  1e-05  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  37.88 
 
 
74 aa  48.1  4e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  36.49 
 
 
89 aa  47  9e-05  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  34.85 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0177  small ribonucleoprotein  41.94 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  42.86 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0866  like-Sm ribonucleoprotein core  37.7 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.39 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00778138 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68190  predicted protein  35.16 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.502273  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0138  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.36 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  37.31 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  33.33 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  35.94 
 
 
86 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10966  small nuclear ribonucleoprotein SmF, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15500)  38.1 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0013173  normal  0.021031 
 
 
-
 
NC_006686  CND03220  mRNA processing-related protein, putative  43.55 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34727  predicted protein  40.35 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  32.81 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06350  RNA cap binding protein, putative  36.84 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20167  predicted protein  38.1 
 
 
87 aa  43.5  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3597  small nuclear riboprotein-like protein  34.85 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0124482 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43771  predicted protein  33.78 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46368  predicted protein  42.42 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.674682  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8518  predicted protein  37.93 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8840  predicted protein  45.31 
 
 
93 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.741263  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10007  U6 small nuclear ribonucleoprotein (Lsm3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12570)  36.99 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0470  like-Sm ribonucleoprotein core  37.5 
 
 
72 aa  41.2  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31317  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1066  Like-Sm ribonucleoprotein core  31.58 
 
 
287 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0398  like-Sm ribonucleoprotein core  37.5 
 
 
72 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0437  like-Sm ribonucleoprotein, core  37.5 
 
 
72 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1521  like-Sm ribonucleoprotein core  37.5 
 
 
72 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0711074  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2097  Like-Sm ribonucleoprotein core  33.33 
 
 
60 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.765143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>