28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0035 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  100 
 
 
152 aa  291  2e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  64.9 
 
 
149 aa  196  7e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2144  PUA domain-containing protein  66.44 
 
 
148 aa  192  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0038  PUA domain-containing protein  62.84 
 
 
163 aa  181  2e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1534  PUA domain-containing protein  42.36 
 
 
157 aa  115  2e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.305531  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  32.82 
 
 
649 aa  68.6  3e-11  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  31.76 
 
 
152 aa  67.8  6e-11  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  28.19 
 
 
606 aa  65.5  2e-10  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1603  PUA domain-containing protein  32.3 
 
 
157 aa  65.5  3e-10  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  32.61 
 
 
160 aa  65.5  3e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  34.53 
 
 
164 aa  65.1  3e-10  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  8.45991e-05 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.23 
 
 
649 aa  63.9  7e-10  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  34.29 
 
 
159 aa  63.9  7e-10  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  30.53 
 
 
649 aa  63.9  8e-10  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  28.15 
 
 
156 aa  63.2  1e-09  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  32.06 
 
 
649 aa  62  2e-09  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  30.41 
 
 
652 aa  58.9  2e-08  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  33.33 
 
 
184 aa  54.3  6e-07  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  31.58 
 
 
155 aa  53.1  1e-06  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  30 
 
 
166 aa  50.8  6e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  32.89 
 
 
172 aa  50.8  6e-06  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  26.76 
 
 
161 aa  44.3  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  36.04 
 
 
176 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  29.77 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  35.54 
 
 
189 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  30.99 
 
 
153 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  29.37 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  30.5 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>