More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0033 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0033  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
403 aa  806  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00542605 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0036  small GTP-binding protein  77.63 
 
 
381 aa  622  1e-177  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1075  small GTP-binding protein  82.49 
 
 
372 aa  618  1e-176  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2146  small GTP-binding protein  76.8 
 
 
385 aa  617  1e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0139  GTP-binding protein HSR1-related  47.12 
 
 
409 aa  327  2e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0708  small GTP-binding protein  47.49 
 
 
424 aa  240  3e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131906  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0351  GTP-binding protein  37.82 
 
 
436 aa  212  8e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.304263  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1605  GTP1/OBG protein  37.8 
 
 
371 aa  206  6e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  37.43 
 
 
489 aa  196  7e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  37.14 
 
 
489 aa  195  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2404  GTP-binding proten HflX  37.78 
 
 
436 aa  192  7e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.115751  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0828  GTP-binding proten HflX  37.43 
 
 
439 aa  192  9e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1550  GTP-binding proten HflX  35.78 
 
 
405 aa  191  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.990824  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  38.56 
 
 
481 aa  190  4e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1710  GTP-binding proten HflX  36.77 
 
 
433 aa  190  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  41.49 
 
 
421 aa  189  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  2.64606e-10 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2411  small GTP-binding protein  37.03 
 
 
413 aa  189  7e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000356758  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  37.01 
 
 
512 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2277  small GTP-binding protein  35.52 
 
 
350 aa  188  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.92801  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1303  GTP-binding proten HflX  35.12 
 
 
449 aa  186  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1246  GTP-binding proten HflX  32.94 
 
 
356 aa  186  6e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  38.4 
 
 
433 aa  185  1e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  38.4 
 
 
433 aa  185  1e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  38.29 
 
 
433 aa  185  2e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  37.18 
 
 
433 aa  184  2e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  39.38 
 
 
414 aa  184  2e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  39.09 
 
 
414 aa  183  4e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  38.33 
 
 
441 aa  183  4e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  37.92 
 
 
460 aa  183  5e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  38.48 
 
 
596 aa  183  5e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  34.69 
 
 
444 aa  183  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  35.07 
 
 
454 aa  182  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  38.33 
 
 
433 aa  183  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  36.9 
 
 
433 aa  182  8e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  39.83 
 
 
509 aa  182  8e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  37.89 
 
 
442 aa  182  9e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  35.59 
 
 
382 aa  182  9e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  34.7 
 
 
450 aa  182  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  37.15 
 
 
414 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  37.5 
 
 
396 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  36.53 
 
 
387 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  37.57 
 
 
387 aa  180  3e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  39.27 
 
 
417 aa  180  3e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  38.3 
 
 
392 aa  180  3e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  36.49 
 
 
433 aa  180  3e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  2.74038e-09 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  37.57 
 
 
387 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  37.84 
 
 
395 aa  180  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  37.57 
 
 
387 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  37.57 
 
 
387 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  37.85 
 
 
433 aa  180  5e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  35.05 
 
 
454 aa  179  6e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  37.29 
 
 
387 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  36.58 
 
 
436 aa  179  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  38.01 
 
 
392 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  36.58 
 
 
428 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  33.82 
 
 
461 aa  179  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  3.56343e-05  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  37.43 
 
 
396 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  37.43 
 
 
395 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  37.43 
 
 
396 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  37.43 
 
 
395 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  34.53 
 
 
431 aa  177  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1857  GTPase  37.5 
 
 
433 aa  176  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.622907  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  34.92 
 
 
440 aa  176  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  37.13 
 
 
396 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  36.47 
 
 
441 aa  176  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  36 
 
 
434 aa  175  1e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  36.61 
 
 
435 aa  175  1e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  35.47 
 
 
502 aa  175  1e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  36.8 
 
 
434 aa  174  2e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  37.39 
 
 
432 aa  174  3e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4684  GTP-binding proten HflX  39.03 
 
 
433 aa  174  4e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712247  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  36.42 
 
 
465 aa  173  4e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3318  GTP-binding proten HflX  37.33 
 
 
433 aa  173  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0425639  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  36.18 
 
 
484 aa  173  6e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  34.75 
 
 
429 aa  173  6e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  6.08691e-12 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  38.18 
 
 
494 aa  172  7e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  37.32 
 
 
404 aa  172  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  7.26108e-05 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  36.67 
 
 
419 aa  172  9e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  3.03435e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  38.4 
 
 
493 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  37.54 
 
 
435 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  9.9061e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  37.32 
 
 
404 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  38.02 
 
 
432 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  36.83 
 
 
433 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  37.46 
 
 
485 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  36.54 
 
 
419 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  35.9 
 
 
432 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  36.54 
 
 
419 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  38.18 
 
 
479 aa  171  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  38.34 
 
 
413 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  37.83 
 
 
487 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  37.24 
 
 
414 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  4.34774e-05 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  34.6 
 
 
444 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  36.8 
 
 
436 aa  170  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  2.11402e-05  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  35.38 
 
 
450 aa  169  6e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  37.26 
 
 
431 aa  169  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  35.99 
 
 
419 aa  169  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  34.54 
 
 
420 aa  169  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  35.65 
 
 
441 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  35.99 
 
 
419 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  36.25 
 
 
503 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>