More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0024 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0024  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
304 aa  616  1e-175  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00458204 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1066  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  85.48 
 
 
304 aa  559  1e-158  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0028  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  81.58 
 
 
305 aa  540  1e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2154  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  80.53 
 
 
305 aa  528  1e-149  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1681  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.25 
 
 
306 aa  408  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.947755  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1121  aspartate carbamoyltransferase  53.62 
 
 
304 aa  337  2e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00702877  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1157  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.25 
 
 
315 aa  328  8e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1678  aspartate carbamoyltransferase  50.33 
 
 
303 aa  302  4e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0959  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
302 aa  299  4e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.67 
 
 
298 aa  298  8e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1256  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.03 
 
 
304 aa  297  1e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1750  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
302 aa  297  2e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.667028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1168  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.84 
 
 
308 aa  293  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0065  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.2 
 
 
308 aa  291  8e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0520  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.82 
 
 
305 aa  287  1e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2668  aspartate carbamoyltransferase  43.81 
 
 
311 aa  283  2e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1686  aspartate carbamoyltransferase  48.67 
 
 
309 aa  283  2e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.467419 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1014  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.68 
 
 
302 aa  283  2e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13562  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0931  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.01 
 
 
302 aa  283  3e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.189832  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1689  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.17 
 
 
298 aa  282  5e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.417019  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.2 
 
 
304 aa  281  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485741  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3294  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.39 
 
 
311 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.773416  normal  0.168026 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2536  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.64 
 
 
298 aa  279  4e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002419  aspartate carbamoyltransferase  48.01 
 
 
309 aa  279  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03647  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.01 
 
 
321 aa  278  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.26 
 
 
298 aa  276  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.934778  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0792  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.84 
 
 
303 aa  275  5e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.311854  hitchhiker  2.16134e-07 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1339  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.18 
 
 
314 aa  275  6e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3465  aspartate carbamoyltransferase  46.36 
 
 
308 aa  273  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1285  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.04 
 
 
313 aa  272  7e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1664  aspartate carbamoyltransferase  46.23 
 
 
317 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0519  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.36 
 
 
309 aa  267  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04113  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.03 
 
 
311 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4726  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.03 
 
 
311 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04077  hypothetical protein  45.03 
 
 
311 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.03 
 
 
311 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4501  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.03 
 
 
311 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.495681  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5767  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.03 
 
 
311 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3749  aspartate carbamoyltransferase  45.03 
 
 
311 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.03 
 
 
311 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.22 
 
 
311 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3766  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.03 
 
 
311 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0447  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.37 
 
 
310 aa  263  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015516 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0420  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.03 
 
 
311 aa  263  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4744  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.22 
 
 
311 aa  262  5e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4713  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.22 
 
 
311 aa  262  5e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465159  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.22 
 
 
311 aa  262  5e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4807  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.22 
 
 
311 aa  262  5e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.55 
 
 
311 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3735  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.55 
 
 
311 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4842  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.89 
 
 
311 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0367  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.03 
 
 
311 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0500  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.89 
 
 
311 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.879834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0436  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.89 
 
 
311 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1158  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.56 
 
 
311 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2092  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.03 
 
 
330 aa  256  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0258  aspartate carbamoyltransferase  44.04 
 
 
341 aa  256  4e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2603  aspartate carbamoyltransferase  41.28 
 
 
359 aa  253  3e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0927  aspartate carbamoyltransferase  43.85 
 
 
411 aa  252  5e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1387  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.45 
 
 
307 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1201  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.12 
 
 
307 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0357  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.81 
 
 
304 aa  242  7e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.127039 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06000  aspartate carbamoyltransferase, putative  43.56 
 
 
2333 aa  241  1e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00636164  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0534  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.11 
 
 
320 aa  241  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.726764  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_19816  aspartate carbamoyltransferase  43.19 
 
 
355 aa  238  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.904682  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0780  aspartate carbamoyltransferase  40.07 
 
 
312 aa  233  4e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90563  multifunctional pyrimidine biosynthesis protein (PYR1)  40.13 
 
 
2211 aa  232  5e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0682407 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2750  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.2 
 
 
307 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00565  Protein pyrABCN [Includes Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate(EC 6.3.5.5);Aspartate carbamoyltransferase(EC 2.1.3.2)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O93937]  39.32 
 
 
2275 aa  228  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2385  aspartate carbamoyltransferase  38.22 
 
 
337 aa  215  7e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000797149 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00485  aspartate carbamoyltransferase  39.49 
 
 
354 aa  213  4e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1310  aspartate carbamoyltransferase  37.97 
 
 
353 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0496  aspartate carbamoyltransferase  37.9 
 
 
334 aa  209  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1821  aspartate carbamoyltransferase  40.66 
 
 
319 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2818  aspartate carbamoyltransferase  36.94 
 
 
339 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0185554  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1172  aspartate carbamoyltransferase  36.31 
 
 
339 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.868394  hitchhiker  9.09543e-06 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1089  aspartate carbamoyltransferase  35.99 
 
 
339 aa  205  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0175924 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1631  aspartate carbamoyltransferase  39.48 
 
 
317 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329226  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1013  aspartate carbamoyltransferase  36.62 
 
 
339 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2979  aspartate carbamoyltransferase  36.62 
 
 
339 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0840  aspartate carbamoyltransferase  36.62 
 
 
339 aa  202  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3070  aspartate carbamoyltransferase  36.31 
 
 
339 aa  201  1e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177283  hitchhiker  2.31142e-07 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0975  aspartate carbamoyltransferase  36.31 
 
 
339 aa  200  2e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1301  aspartate carbamoyltransferase  36.31 
 
 
339 aa  201  2e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1238  aspartate carbamoyltransferase  36.31 
 
 
339 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324325  normal  0.849044 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1160  aspartate carbamoyltransferase  36.31 
 
 
339 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1205  aspartate carbamoyltransferase  36.31 
 
 
339 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3152  aspartate carbamoyltransferase  36.31 
 
 
339 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2892  aspartate carbamoyltransferase  35.99 
 
 
339 aa  198  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  6.46707e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2974  aspartate carbamoyltransferase  35.99 
 
 
339 aa  198  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.771766  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1305  aspartate carbamoyltransferase  42.56 
 
 
310 aa  198  9e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1120  aspartate carbamoyltransferase  35.99 
 
 
339 aa  197  2e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0063  aspartate carbamoyltransferase  38.46 
 
 
343 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.631606  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  36.54 
 
 
312 aa  192  8e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  3.14766e-08 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4628  aspartate carbamoyltransferase  36.31 
 
 
337 aa  190  3e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1204  aspartate carbamoyltransferase  36.25 
 
 
431 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0897  aspartate carbamoyltransferase  36.01 
 
 
431 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25183  predicted protein  37.19 
 
 
334 aa  186  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.181735  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3798  aspartate carbamoyltransferase  36.01 
 
 
431 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181343 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2847  aspartate carbamoyltransferase  36.94 
 
 
339 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.737725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>