28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0014 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  100 
 
 
91 aa  167  4e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.274435 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1052  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  81.72 
 
 
93 aa  118  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.313485 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0018  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  71.6 
 
 
88 aa  68.9  2e-11  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2274  V-type ATP synthase subunit K  64.1 
 
 
89 aa  60.5  9e-09  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1105  H+transporting two-sector ATPase C subunit  35.64 
 
 
142 aa  53.5  9e-07  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0520  H+transporting two-sector ATPase C subunit  47.69 
 
 
139 aa  53.1  1e-06  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35397  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  33.75 
 
 
159 aa  51.6  3e-06  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175083  normal  0.827504 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1688  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.61 
 
 
102 aa  50.8  7e-06  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.422777 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  39.13 
 
 
142 aa  48.9  2e-05  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03340  hydrogen ion transporter, putative  38.71 
 
 
190 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000569268  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03088  hypothetical protein similar to vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit (Broad)  42.37 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06127  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  40.68 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69588  vacuolar ATPase V0 domain subunit c  38.98 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.406866 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2086  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  35.48 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.185721  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  36.67 
 
 
222 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  36.67 
 
 
222 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  36.67 
 
 
222 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0363  V-type ATP synthase subunit K  36.67 
 
 
222 aa  43.5  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119546  vacuolar type H+-ATPase proteolipid subunit  31.33 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10305  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  38.33 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813751  normal  0.842238 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21882  predicted protein  33.8 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.854238  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29011  predicted protein  33.8 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00069003  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2681  H+transporting two-sector ATPase C subunit  41.27 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0243152  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1179  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  42.19 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00560744  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.5 
 
 
606 aa  40.8  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02690  conserved hypothetical protein  35.82 
 
 
164 aa  40.8  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3459  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40.98 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19430  V-type ATP synthase subunit C  46.58 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>