32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0002 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0002  regulatory protein ArsR  100 
 
 
92 aa  175  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0660  ArsR family transcriptional regulator  68.18 
 
 
96 aa  119  2e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410209  normal  0.0250069 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0003  regulatory protein, ArsR  65.12 
 
 
95 aa  109  2e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0006  regulatory protein, ArsR  59.3 
 
 
98 aa  96.3  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1426  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.134473 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1885  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
92 aa  84  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.528745 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0836  regulatory protein, ArsR  38.2 
 
 
90 aa  72  2e-12  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0924  regulatory protein ArsR  38.64 
 
 
93 aa  66.6  1e-10  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
297 aa  47.8  5e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
108 aa  47.8  5e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  43.86 
 
 
191 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
354 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 
94 aa  42.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
349 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 
342 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  39.39 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5019  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
224 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  28.95 
 
 
131 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  4.53707e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0453  putative transcriptional regulator  28.75 
 
 
106 aa  41.2  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.701032 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2895  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 
322 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0512058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
210 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  34.04 
 
 
211 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  43.4 
 
 
112 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
120 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>