More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3896 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  100 
 
 
133 aa  264  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  54.41 
 
 
137 aa  126  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  52.86 
 
 
138 aa  124  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  50.74 
 
 
136 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  50.74 
 
 
136 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  48.53 
 
 
136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  48.53 
 
 
136 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  46.21 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  47.73 
 
 
139 aa  107  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  48.28 
 
 
146 aa  104  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3422  fimbrial protein pilin  52.63 
 
 
148 aa  94.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3176  Fimbrial protein pilin  54.35 
 
 
137 aa  94  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2112  fimbrial protein  46.94 
 
 
146 aa  88.6  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2033  fimbrial protein pilin  46.26 
 
 
146 aa  85.9  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.244331  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  41.3 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2031  fimbrial protein pilin  45.93 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.187958  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  37.5 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0638  fimbrillin  35.12 
 
 
177 aa  82  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.37134  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  40.85 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0896  fimbrillin  30.59 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  43.09 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2109  fimbrial protein  45.19 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0797  pilin  44.76 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  41.45 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  41.26 
 
 
160 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  34.97 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  71.43 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1143  fimbrillin  30 
 
 
180 aa  76.6  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  64.29 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  61.29 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  36.91 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  41.73 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  51.76 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0441  Fimbrial protein pilin  40.13 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  37.16 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  69.23 
 
 
196 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  77.27 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  59.42 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  51.28 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  62.5 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0271  putative pilin protein PilA  35.51 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.384028 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  67.27 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  61.82 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  68 
 
 
179 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  59.38 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  37.78 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  50 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  57.38 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  61.82 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  32.52 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  66.67 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  47.92 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  53.57 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  53.57 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  62 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  46.73 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  78.95 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  58.18 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  36.17 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  76.92 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  36.62 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  63.64 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  65.31 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  35.29 
 
 
179 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  41.84 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  37.59 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  62.26 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  63.27 
 
 
147 aa  62  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  83.33 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0864  peptidase S49, protease IV  67.24 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  47.27 
 
 
207 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  83.33 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  47.27 
 
 
207 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  46.48 
 
 
198 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  72.5 
 
 
157 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0473  fimbrial protein pilin  34.97 
 
 
139 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  46.48 
 
 
198 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  57.14 
 
 
148 aa  60.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  46.48 
 
 
198 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  59.18 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0252  fimbrial protein pilin  34.78 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  38.74 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  68.42 
 
 
171 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  33.58 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  54 
 
 
198 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  59.18 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  47.14 
 
 
199 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  54 
 
 
198 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  54 
 
 
198 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  53.85 
 
 
170 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  62.75 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  71.79 
 
 
188 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  67.44 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  57.14 
 
 
162 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  54.9 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0230  Fimbrial protein pilin  34.29 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  43.48 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  40 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  53.12 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  47.37 
 
 
133 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>