26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3849 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3849  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  343  6e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125049  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  42.94 
 
 		 179 aa  137  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  33.94 
 
 		 182 aa  89  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  32.19 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  30.46 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  34.27 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  30.87 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  28.38 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  27.1 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  29.11 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  28.74 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_003296  RS01895  putative transmembrane protein  36.18 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0216755  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3745  putative transmembrane protein  30.2 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0901  putative transmembrane protein  33.11 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0767133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  30.2 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  26.28 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0768  hypothetical protein  23.84 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  29.29 
 
 		 146 aa  50.8  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1551  hypothetical protein  22.76 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5029  putative transmembrane protein  26.67 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.313273  normal  0.903322 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  25.81 
 
 		 188 aa  47.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  25.81 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4467  putative transmembrane protein  28.1 
 
 		 190 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00546453  normal  0.335651 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4601  putative transmembrane protein  28.1 
 
 		 190 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0346452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  29.75 
 
 		 185 aa  44.3  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1282  hypothetical protein  27.08 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>