More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3847 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
921 aa  1840    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  42.93 
 
 
923 aa  625  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 
977 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.2 
 
 
818 aa  492  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.62 
 
 
1202 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.19 
 
 
818 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  46.68 
 
 
781 aa  478  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 
1240 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  47.34 
 
 
1346 aa  466  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  40.21 
 
 
1001 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.69 
 
 
946 aa  455  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.33 
 
 
1499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  40.98 
 
 
1763 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  38.32 
 
 
1014 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  45.01 
 
 
1177 aa  444  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.78 
 
 
1118 aa  445  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.31 
 
 
812 aa  441  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  38.98 
 
 
1765 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 
1767 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.88 
 
 
705 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.52 
 
 
1767 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 
1768 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
1767 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.91 
 
 
1326 aa  435  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 
1069 aa  435  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
758 aa  431  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
1771 aa  432  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  46.25 
 
 
977 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 
950 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
925 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1255 aa  428  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 
1765 aa  429  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
1369 aa  429  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  43.58 
 
 
1030 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 
1784 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.54 
 
 
1782 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 
1786 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 
1548 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 
1040 aa  420  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.28 
 
 
1284 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 
1820 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 
1792 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 
1550 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 
1310 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 
816 aa  419  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.78 
 
 
1072 aa  416  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  44.67 
 
 
847 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 
835 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 
2654 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  37.54 
 
 
2035 aa  412  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.49 
 
 
916 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  38.63 
 
 
1135 aa  412  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.34 
 
 
1397 aa  412  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  39.22 
 
 
727 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.04 
 
 
1398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 
1165 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 
1240 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.3 
 
 
1090 aa  405  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.39 
 
 
1109 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
899 aa  406  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 
1582 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 
1363 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 
1005 aa  402  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
936 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  42 
 
 
1124 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
1480 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
876 aa  399  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 
1130 aa  399  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.59 
 
 
833 aa  398  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 
1245 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 
1266 aa  393  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  34.9 
 
 
833 aa  395  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  39.7 
 
 
750 aa  395  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  36.48 
 
 
1322 aa  393  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 
1033 aa  392  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 
929 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.59 
 
 
1611 aa  392  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  35.78 
 
 
1574 aa  391  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3895  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 
920 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.750763  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.28 
 
 
2213 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 
981 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.3 
 
 
1442 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 
1267 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.45 
 
 
778 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 
1340 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.06 
 
 
1433 aa  386  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 
801 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  34.69 
 
 
1683 aa  382  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3510  ATPase domain-containing protein  38.85 
 
 
932 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 
770 aa  382  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 
1384 aa  382  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 
1305 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.62 
 
 
1331 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
1245 aa  382  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  39.5 
 
 
1351 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 
1622 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.46 
 
 
1603 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.1 
 
 
1468 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 
957 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 
993 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>