223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3705 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  100 
 
 
387 aa  781  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  55.05 
 
 
399 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0282  putative RNA methylase:THUMP  58.24 
 
 
380 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377639  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  53.42 
 
 
385 aa  428  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2424  N6-adenine-specific DNA methylase  50.26 
 
 
398 aa  364  2e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0598  putative RNA methylase  47.39 
 
 
432 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116947  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0623  putative RNA methylase  47.16 
 
 
432 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244531  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0696  putative RNA methylase  48.36 
 
 
433 aa  357  2e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273634  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4003  hypothetical protein  48.46 
 
 
430 aa  357  2e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656935  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0224  putative RNA methylase  48.33 
 
 
434 aa  356  3e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0708  putative RNA methylase  48.33 
 
 
434 aa  356  3e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0675  putative RNA methylase  48.33 
 
 
434 aa  356  4e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.936037  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1265  THUMP domain-containing protein  49.76 
 
 
430 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2537  putative RNA methylase  47.49 
 
 
425 aa  353  3e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2557  THUMP domain-containing protein  49.52 
 
 
430 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3378  THUMP domain-containing protein  49.52 
 
 
430 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.270297  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3795  putative RNA methylase  47.99 
 
 
433 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405369  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0288  THUMP domain-containing protein  49.52 
 
 
430 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1150  THUMP domain-containing protein  49.52 
 
 
430 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3387  N6-adenine-specific DNA methylase  49.52 
 
 
430 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2374  THUMP domain-containing protein  49.52 
 
 
430 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3344  THUMP domain-containing protein  49.28 
 
 
430 aa  352  9e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615958  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2677  putative RNA methylase  47.87 
 
 
432 aa  348  7e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2967  putative RNA methylase  49.04 
 
 
419 aa  348  8e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2828  putative RNA methylase:THUMP  48.32 
 
 
417 aa  348  9e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2568  putative RNA methylase  42.95 
 
 
472 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.509771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2978  putative RNA methylase  42.79 
 
 
472 aa  312  6e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0339  putative RNA methylase  44.25 
 
 
437 aa  311  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.179905  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0350  putative RNA methylase  44.25 
 
 
440 aa  310  3e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0422  putative RNA methylase  44.12 
 
 
441 aa  305  8e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0579  putative RNA methylase  42.89 
 
 
430 aa  299  7e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0473  putative RNA methylase  41.95 
 
 
413 aa  298  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0683  putative RNA methylase  41.08 
 
 
426 aa  297  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0237  putative RNA methylase  38.14 
 
 
485 aa  289  5e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.601089  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0779  putative RNA methylase  40.96 
 
 
428 aa  283  5e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  40.37 
 
 
375 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.18402e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0259  putative RNA methylase  37.76 
 
 
480 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  40.86 
 
 
376 aa  276  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  40.32 
 
 
376 aa  270  3e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  36.1 
 
 
375 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  36.1 
 
 
375 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.66 
 
 
709 aa  268  8e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  38.98 
 
 
389 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.92 
 
 
709 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.68014e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.66 
 
 
709 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2739  hypothetical protein  48.02 
 
 
471 aa  266  3e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.895962  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.66 
 
 
709 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.5 
 
 
712 aa  266  6e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.14 
 
 
709 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.4 
 
 
711 aa  263  5e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  39.95 
 
 
393 aa  262  7e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4180  putative RNA methylase  41.73 
 
 
440 aa  262  7e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  38.98 
 
 
391 aa  262  8e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4484  putative RNA methylase  46.3 
 
 
468 aa  262  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.88 
 
 
711 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  38.65 
 
 
393 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.97 
 
 
749 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.14 
 
 
713 aa  260  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.88 
 
 
713 aa  259  6e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.88 
 
 
713 aa  259  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3711  putative RNA methylase  45.19 
 
 
471 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.770893  normal  0.0760034 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.37 
 
 
713 aa  255  1e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03361  RNA methylase family protein  38.46 
 
 
374 aa  254  2e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.14 
 
 
708 aa  253  4e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  37.84 
 
 
374 aa  251  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.84 
 
 
711 aa  247  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.88 
 
 
711 aa  246  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  35.56 
 
 
375 aa  246  5e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.43 
 
 
721 aa  244  2e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  36.81 
 
 
380 aa  240  3e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00591  RNA methylase family protein  35.71 
 
 
374 aa  239  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.35 
 
 
725 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.5 
 
 
705 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0499  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.03 
 
 
734 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.639423  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.77 
 
 
705 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.24 
 
 
738 aa  237  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.96 
 
 
706 aa  236  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.96 
 
 
706 aa  236  8e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.96 
 
 
706 aa  236  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2250  putative RNA methylase  39.62 
 
 
380 aa  235  1e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.959304  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.06 
 
 
711 aa  234  2e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1952  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.8 
 
 
712 aa  234  2e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64464  normal  0.031867 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1460  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.41 
 
 
702 aa  234  2e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.372421  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.36 
 
 
705 aa  234  2e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  33.78 
 
 
374 aa  233  4e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1680  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.29 
 
 
707 aa  233  6e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0022  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.73 
 
 
707 aa  233  6e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0023  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.64 
 
 
707 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2096  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.56 
 
 
730 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.24 
 
 
706 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3643  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.56 
 
 
730 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1608  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.56 
 
 
730 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0054  putative RNA methylase  31.87 
 
 
374 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01161  RNA methylase family protein  35.07 
 
 
374 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00768  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.73 
 
 
711 aa  230  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1615  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.68 
 
 
730 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  5.68261e-05 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1488  hypothetical protein  35.84 
 
 
393 aa  229  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00216876  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.05 
 
 
702 aa  229  6e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1362  hypothetical protein  36.89 
 
 
484 aa  229  8e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.11 
 
 
718 aa  228  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>