More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3624 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
571 aa  1103    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  39.4 
 
 
572 aa  360  5e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  37.98 
 
 
573 aa  352  8.999999999999999e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  38.97 
 
 
562 aa  346  6e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  42.19 
 
 
592 aa  319  7e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  37.97 
 
 
635 aa  303  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  37.77 
 
 
581 aa  301  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 
607 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 
607 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  37.89 
 
 
607 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  36.98 
 
 
607 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  37.85 
 
 
616 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  37.06 
 
 
606 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 
607 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  36.4 
 
 
613 aa  281  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  36.22 
 
 
613 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  36.51 
 
 
606 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  36.51 
 
 
606 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  36.51 
 
 
606 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  36.51 
 
 
606 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 
606 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  36.51 
 
 
606 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 
606 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 
607 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 
607 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  36.2 
 
 
645 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  37.11 
 
 
587 aa  267  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
613 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  36.09 
 
 
642 aa  264  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.02 
 
 
645 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  36.9 
 
 
625 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.48 
 
 
574 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  36.06 
 
 
609 aa  248  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  37.16 
 
 
594 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  33.74 
 
 
574 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 
599 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 
574 aa  241  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  36.01 
 
 
584 aa  239  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  34.84 
 
 
595 aa  237  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  34.85 
 
 
616 aa  236  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  36.09 
 
 
595 aa  234  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  33.89 
 
 
620 aa  230  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  33.51 
 
 
586 aa  228  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 
585 aa  225  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  37.36 
 
 
584 aa  224  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 
556 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  32.81 
 
 
575 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  35.7 
 
 
520 aa  216  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 
575 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  33.22 
 
 
573 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  33.4 
 
 
590 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  33.52 
 
 
575 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 
573 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  33.22 
 
 
573 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 
573 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  30.76 
 
 
603 aa  196  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.76 
 
 
553 aa  195  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.22 
 
 
582 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.86 
 
 
564 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  34.62 
 
 
591 aa  170  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  32.55 
 
 
551 aa  160  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  46.15 
 
 
494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
559 aa  150  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  49.32 
 
 
495 aa  150  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  32.09 
 
 
559 aa  150  9e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.84 
 
 
574 aa  137  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
567 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  40.42 
 
 
619 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 
606 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
621 aa  126  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  43.55 
 
 
464 aa  124  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  30.53 
 
 
621 aa  124  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  30.53 
 
 
621 aa  124  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  32.07 
 
 
619 aa  120  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  33.45 
 
 
677 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  38.56 
 
 
595 aa  118  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.87 
 
 
563 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
594 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
610 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 
610 aa  114  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 
603 aa  113  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  33.69 
 
 
566 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 
572 aa  111  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 
568 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  33.1 
 
 
583 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  33.11 
 
 
425 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 
579 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  33.21 
 
 
607 aa  110  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 
562 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  42.46 
 
 
638 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  35.97 
 
 
642 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
585 aa  107  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  31.96 
 
 
593 aa  105  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  32.51 
 
 
593 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  27.62 
 
 
573 aa  103  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
617 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.42 
 
 
594 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.53 
 
 
572 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  28.07 
 
 
573 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.35 
 
 
566 aa  100  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>