115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3599 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3599  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 		 532 aa  1082    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.743632  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  36.27 
 
 		 460 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3010  restriction endonuclease S subunits-like protein  31.78 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116402  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02063  type I restriction-modification system, S subunit  29.53 
 
 		 501 aa  151  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  29.89 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  28.35 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5276  restriction modification system DNA specificity subunit  25.54 
 
 		 418 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  27.03 
 
 		 435 aa  120  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  30.36 
 
 		 456 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.59 
 
 		 457 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2960  restriction modification system DNA specificity subunit  30.03 
 
 		 587 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  27.16 
 
 		 437 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3673  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.5 
 
 		 459 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0900  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.07 
 
 		 471 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3649  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.67 
 
 		 464 aa  106  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.18 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  24.25 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1978  restriction modification system DNA specificity subunit  34.09 
 
 		 616 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4264  type I restriction-modification system, S subunit  29.14 
 
 		 495 aa  103  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  27.73 
 
 		 416 aa  100  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  26.36 
 
 		 450 aa  100  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1032  restriction modification system DNA specificity subunit  28.43 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41908  normal  0.322454 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  26.91 
 
 		 400 aa  94.7  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  24.45 
 
 		 420 aa  94.7  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.32 
 
 		 477 aa  94.4  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  30.81 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.87 
 
 		 620 aa  93.2  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.47 
 
 		 462 aa  91.3  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1027  restriction modification system DNA specificity subunit  28.33 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2016  restriction modification system DNA specificity subunit  31.4 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0839323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  25.79 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  31.19 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.49 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.58 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  28 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  34.59 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  22.89 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3267  restriction modification system DNA specificity subunit  25.54 
 
 		 557 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0920403  decreased coverage  0.00535253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2086  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.46 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000683293 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  29.19 
 
 		 846 aa  73.6  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  23.91 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1954  restriction modification system DNA specificity subunit  32.3 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1132  restriction modification system DNA specificity subunit  25.23 
 
 		 556 aa  69.7  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.817215  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1672  restriction modification system DNA specificity domain protein  49.25 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04178  hypothetical protein  32.73 
 
 		 236 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.695524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  20.67 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1204  restriction modification system DNA specificity subunit  37.04 
 
 		 547 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340549  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  25.86 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  22.05 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0086  restriction modification system DNA specificity protein  38.89 
 
 		 538 aa  61.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  27.86 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  24.23 
 
 		 549 aa  60.1  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  22.32 
 
 		 285 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1176  restriction modification system DNA specificity subunit  22.68 
 
 		 408 aa  59.7  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.882603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  22.34 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  18.31 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  23.44 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05614  type I restriction-modification system S subunit  23.34 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  21.15 
 
 		 528 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.99 
 
 		 419 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  26.79 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  26.79 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4454  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.77 
 
 		 406 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2744  type I restriction-modification system, S subunit  31.5 
 
 		 532 aa  56.2  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181132  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.08 
 
 		 413 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  24.36 
 
 		 453 aa  55.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0500  restriction modification system DNA specificity subunit  28.93 
 
 		 413 aa  55.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.565018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1015  restriction modification system DNA specificity subunit  25.78 
 
 		 575 aa  55.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  22.44 
 
 		 411 aa  55.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.72 
 
 		 565 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  20.94 
 
 		 390 aa  55.1  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  23.14 
 
 		 427 aa  54.3  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3719  restriction modification system DNA specificity subunit  24.06 
 
 		 585 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  23.2 
 
 		 433 aa  53.9  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2862  restriction modification system DNA specificity subunit  68.42 
 
 		 589 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  21.43 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4880  putative type I restriction-modification system S subunit  68.42 
 
 		 571 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.960431 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1237  restriction modification system DNA specificity subunit  26.47 
 
 		 633 aa  51.6  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6044  type I restriction-modification system subunit S  58.7 
 
 		 547 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.061065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.32 
 
 		 442 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5859  putative type I restriction-modification system, S subunit  65.79 
 
 		 584 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.65 
 
 		 408 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.82 
 
 		 427 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  25.08 
 
 		 429 aa  50.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3549  restriction modification system DNA specificity subunit  21.31 
 
 		 296 aa  50.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1093  restriction modification system DNA specificity subunit  21.14 
 
 		 394 aa  50.8  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3953  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.57 
 
 		 413 aa  50.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  24.5 
 
 		 290 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4742  type I restriction-modification system, S subunit  58.7 
 
 		 576 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266617  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12774  type I restriction/modification system specificity determinant hsdS  26.54 
 
 		 364 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  25.38 
 
 		 464 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  31.31 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0854  restriction modification system DNA specificity subunit  32.22 
 
 		 595 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221182  normal  0.0643125 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  24.16 
 
 		 415 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  22.96 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3227  restriction modification system DNA specificity subunit  30.77 
 
 		 575 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0835  restriction modification system DNA specificity domain  63.16 
 
 		 563 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.835919  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0686  type I restriction-modification system, S subunit, putative  63.16 
 
 		 561 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.840975  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  23.19 
 
 		 456 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02076  hypothetical protein  30.59 
 
 		 292 aa  48.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>