46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3594 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  100 
 
 
351 aa  726  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  2.10462e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  74.62 
 
 
331 aa  533  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  56.52 
 
 
345 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  52.81 
 
 
353 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  3.61839e-07 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  51 
 
 
346 aa  357  2e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  47.88 
 
 
349 aa  345  8e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  45.94 
 
 
351 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  47.61 
 
 
353 aa  320  2e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  47.58 
 
 
354 aa  318  6e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  47.35 
 
 
357 aa  316  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  44.99 
 
 
345 aa  307  1e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  5.29825e-06  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  44.19 
 
 
352 aa  275  1e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.22819e-51  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  41.81 
 
 
362 aa  259  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  42.18 
 
 
355 aa  256  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  41.1 
 
 
360 aa  249  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  1.26999e-15 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  40.72 
 
 
356 aa  239  7e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  41.49 
 
 
362 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  37.94 
 
 
397 aa  212  8e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  36.03 
 
 
341 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  50 
 
 
150 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1810  Appr-1-p processing enzyme  39.46 
 
 
254 aa  152  9e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.175893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  47.79 
 
 
136 aa  113  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  40.74 
 
 
242 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  32.76 
 
 
393 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  1.46563e-05  unclonable  1.20063e-09 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  34.93 
 
 
392 aa  88.2  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  32.03 
 
 
163 aa  73.6  5e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  32.86 
 
 
146 aa  69.7  7e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3196  Appr-1-p processing domain protein  31.72 
 
 
165 aa  68.6  2e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3357  Appr-1-p processing domain protein  33.08 
 
 
162 aa  65.1  2e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  27.74 
 
 
158 aa  62  2e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2476  Appr-1-p processing domain protein  28.93 
 
 
161 aa  57.8  3e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  3.70869e-05 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  27.67 
 
 
168 aa  57.4  4e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  30.22 
 
 
152 aa  56.6  6e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0081  hypothetical protein  26.23 
 
 
190 aa  54.3  3e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.71142  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  26.45 
 
 
168 aa  54.3  3e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1069  appr-1-p processing domain-containing protein  27.59 
 
 
147 aa  49.7  7e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3993  hypothetical protein  27.27 
 
 
141 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  5.20156e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2786  Appr-1-p processing  26.57 
 
 
152 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  29.17 
 
 
181 aa  46.6  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3492  Appr-1-p processing domain protein  26.03 
 
 
179 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0052  Appr-1-p processing domain protein  30 
 
 
159 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2376  hypothetical protein  28.97 
 
 
142 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0220429  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49619  predicted protein  27.42 
 
 
173 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.624995  normal  0.141248 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1160  appr-1-p processing domain-containing protein  25.62 
 
 
167 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.429654  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0421  hypothetical protein  25.89 
 
 
146 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0143355  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0960  Appr-1-p processing  27.86 
 
 
179 aa  42.7  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>