More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3551 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
531 aa  1097    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  55.66 
 
 
527 aa  615  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  55.53 
 
 
526 aa  617  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  51.61 
 
 
529 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  52.68 
 
 
556 aa  566  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  51.46 
 
 
530 aa  558  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  47.05 
 
 
528 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  45.99 
 
 
528 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  44.93 
 
 
527 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  45.33 
 
 
528 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  45.14 
 
 
528 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  44.55 
 
 
526 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  45.32 
 
 
528 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  44.97 
 
 
526 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  43.14 
 
 
528 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  42.97 
 
 
544 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  43.06 
 
 
526 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 
526 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  41.45 
 
 
538 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  43.08 
 
 
532 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  39.84 
 
 
531 aa  392  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  40.19 
 
 
532 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  41.62 
 
 
524 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  41.83 
 
 
523 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  41.83 
 
 
523 aa  382  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  40.51 
 
 
517 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  41.45 
 
 
460 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0422  extracellular solute-binding protein  40.8 
 
 
527 aa  354  2.9999999999999997e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147362  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0423  extracellular solute-binding protein  41.82 
 
 
527 aa  347  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204725  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  37.08 
 
 
520 aa  341  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  36.24 
 
 
526 aa  332  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  38.3 
 
 
542 aa  325  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  37.28 
 
 
526 aa  325  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  38 
 
 
514 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 
514 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  36.47 
 
 
517 aa  310  4e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  36.47 
 
 
516 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  35.28 
 
 
518 aa  302  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  36.5 
 
 
517 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  36.05 
 
 
519 aa  292  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 
520 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 
520 aa  282  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  35.16 
 
 
520 aa  281  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  34.33 
 
 
516 aa  276  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  34.33 
 
 
516 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  34.72 
 
 
595 aa  272  9e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  33.54 
 
 
514 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 
535 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.4 
 
 
530 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  31.96 
 
 
512 aa  258  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  34.33 
 
 
532 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  35.48 
 
 
526 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  33.73 
 
 
528 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2474  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 
525 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  34.13 
 
 
532 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  36.11 
 
 
522 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  36.36 
 
 
525 aa  249  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 
528 aa  247  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  31.46 
 
 
533 aa  247  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  31.59 
 
 
533 aa  246  9e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 
531 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 
535 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 
538 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 
515 aa  238  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 
544 aa  237  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  32.67 
 
 
549 aa  235  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  30.65 
 
 
509 aa  233  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  32.08 
 
 
524 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.93 
 
 
521 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 
521 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.89 
 
 
534 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  29.19 
 
 
537 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 
505 aa  204  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  29.76 
 
 
516 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  28.1 
 
 
527 aa  196  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.57 
 
 
535 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 
534 aa  193  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 
534 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 
497 aa  190  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.47 
 
 
532 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.66 
 
 
510 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3737  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 
517 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  29.73 
 
 
495 aa  177  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
528 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 
495 aa  173  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  28.57 
 
 
502 aa  171  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 
500 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  29.56 
 
 
513 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  28.4 
 
 
554 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.6 
 
 
554 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  27.63 
 
 
524 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  28.91 
 
 
520 aa  166  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 
520 aa  166  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.87 
 
 
509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  28.76 
 
 
531 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.99 
 
 
520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  28.19 
 
 
520 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>