32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3534 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 108 aa  206  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  38.83 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  38.83 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  44.12 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  41.05 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  36.73 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  39.42 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  40.38 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  32.08 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  38.38 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  39.39 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0562  hypothetical protein  44.44 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3607  branched-chain amino acid transport  37.5 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.459125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  37.14 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  31.43 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0498  branched-chain amino acid transport  37.62 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  38.83 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  40.4 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  36.27 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  32.11 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  35.64 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  30.19 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3278  branched-chain amino acid transport  39.39 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.619269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  27.08 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  35.62 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  34.44 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1896  branched-chain amino acid transport  30.3 
 
 		 104 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  27.08 
 
 		 112 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3400  branched-chain amino acid transport  29.41 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.737178  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  27.08 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4055  branched-chain amino acid transport  29.41 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.461564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  38.1 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>