160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3518 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  100 
 
 
253 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  43.83 
 
 
212 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  66.67 
 
 
228 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  61.22 
 
 
244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  60.92 
 
 
234 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  47.22 
 
 
193 aa  113  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  49.18 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  59.77 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  59.77 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  57.47 
 
 
232 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  59.3 
 
 
273 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  54.02 
 
 
256 aa  101  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  59.3 
 
 
266 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  59.3 
 
 
266 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  55.17 
 
 
270 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  55.17 
 
 
264 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  48.28 
 
 
233 aa  95.9  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  51.72 
 
 
285 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  55.81 
 
 
280 aa  95.1  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  56.47 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  54.65 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  54.65 
 
 
275 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  36.89 
 
 
287 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  54.65 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  51.16 
 
 
277 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  51.16 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  41.78 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  48.35 
 
 
276 aa  89.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  52.87 
 
 
285 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  51.61 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  54.65 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  52.86 
 
 
259 aa  82  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  48.35 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  48.35 
 
 
274 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  42.45 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  42.45 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  51.72 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  50.59 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  37.09 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  36.84 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  46.43 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  45.45 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  45.12 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  42.39 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  33.15 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  45.12 
 
 
212 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  36.96 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  46.43 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  43.75 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  40.48 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  46.84 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  45.24 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  45.24 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  41.03 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  41.46 
 
 
208 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  42.31 
 
 
224 aa  62.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  34.82 
 
 
239 aa  61.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  43.53 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  40.51 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  39.74 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  43.48 
 
 
267 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  39.74 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  34.52 
 
 
243 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  44.87 
 
 
228 aa  58.9  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  34.52 
 
 
244 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  34.52 
 
 
239 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  34.52 
 
 
244 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  34.52 
 
 
239 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  34.52 
 
 
239 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  34.52 
 
 
239 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  34.52 
 
 
239 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  27.27 
 
 
275 aa  56.6  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  30.65 
 
 
267 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3737  TonB-like  43.96 
 
 
272 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  28.57 
 
 
259 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  33.63 
 
 
242 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  33.63 
 
 
242 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  35.37 
 
 
212 aa  55.8  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  29.48 
 
 
219 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  35.42 
 
 
233 aa  55.5  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  31.46 
 
 
221 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0897  TonB protein  32.18 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18999  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  32.73 
 
 
218 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  33.33 
 
 
319 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  29.66 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  32.69 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  35.2 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  39.24 
 
 
293 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  34.52 
 
 
223 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  34.15 
 
 
332 aa  52.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  37.93 
 
 
475 aa  52.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  23.81 
 
 
256 aa  52.4  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  31.71 
 
 
277 aa  52.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  30.36 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  36.71 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  32.94 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  34.62 
 
 
614 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  34.86 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  31.76 
 
 
138 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  38.1 
 
 
269 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>