More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3500 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3500  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 312 aa  618  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  56.58 
 
 		 309 aa  316  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  53.47 
 
 		 316 aa  316  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  56.58 
 
 		 309 aa  315  7e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  52.49 
 
 		 304 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  54.39 
 
 		 307 aa  301  9e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  55.12 
 
 		 301 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  50.33 
 
 		 305 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  50.32 
 
 		 294 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  50.83 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  49.82 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  54.3 
 
 		 311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  49.51 
 
 		 313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  49.5 
 
 		 301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  46.42 
 
 		 303 aa  275  6e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  49.83 
 
 		 291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  46.67 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  51.26 
 
 		 307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  48.56 
 
 		 301 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  46.98 
 
 		 292 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  47.87 
 
 		 298 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  51.14 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  51.19 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  46.1 
 
 		 292 aa  262  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  44.78 
 
 		 292 aa  259  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  44.63 
 
 		 292 aa  259  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  44.78 
 
 		 292 aa  258  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  49.33 
 
 		 320 aa  256  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  45.28 
 
 		 333 aa  255  6e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  46.05 
 
 		 298 aa  255  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  44.31 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  49.17 
 
 		 289 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  42.38 
 
 		 292 aa  252  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  44.55 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  44.66 
 
 		 311 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  42.81 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  43.79 
 
 		 298 aa  245  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.11 
 
 		 315 aa  245  6.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  43.89 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  42.9 
 
 		 299 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  45.55 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  43.36 
 
 		 307 aa  225  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  34.93 
 
 		 353 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  32.69 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  35.18 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  31.75 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  36.33 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1259  periplasmic solute binding protein  36.18 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.44 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  29.37 
 
 		 311 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  29.37 
 
 		 311 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.44 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.44 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.11 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.11 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  29.93 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  30.97 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  29.61 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  33.57 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  41.58 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0722  AfeA  30.9 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.738909  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  28.05 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.49 
 
 		 313 aa  162  9e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  33.22 
 
 		 287 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  35.93 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  34.22 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  35.84 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  34.62 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  34.11 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  31.43 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2895  twin-arginine translocation pathway signal  35 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  32.26 
 
 		 316 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  35.48 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  35.84 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  34.25 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  31.23 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  32.75 
 
 		 346 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  34.88 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  31.74 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.41 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3371  periplasmic solute binding protein  34.17 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  35.39 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  31.27 
 
 		 328 aa  152  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  40.76 
 
 		 494 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  29.39 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  31.03 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1659  metal ABC transporter substrate-binding lipoprotein  31.93 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160044 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  30.69 
 
 		 286 aa  150  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  32.39 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 		 322 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  28.48 
 
 		 308 aa  148  9e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  30.75 
 
 		 335 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  30.77 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  29.69 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  30.77 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  29.39 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>