More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3337 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3337  50S ribosomal protein L4  100 
 
 
206 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  3.30441e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0768  50S ribosomal protein L4  74.51 
 
 
206 aa  321  6e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0320  50S ribosomal protein L4  71.84 
 
 
207 aa  310  8e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.18695e-20  hitchhiker  6.67461e-06 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3442  50S ribosomal protein L4  70.44 
 
 
206 aa  298  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000201119  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3168  50S ribosomal protein L4  68.47 
 
 
206 aa  296  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  4.73803e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2631  50S ribosomal protein L4  68.47 
 
 
206 aa  296  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  9.57923e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1925  50S ribosomal protein L4  68.47 
 
 
206 aa  296  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  9.66469e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3479  50S ribosomal protein L4  68.47 
 
 
206 aa  296  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  9.52681e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3803  50S ribosomal protein L4  68.47 
 
 
206 aa  296  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00357081  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2949  50S ribosomal protein L4  69.95 
 
 
206 aa  296  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  3.39858e-05  decreased coverage  1.35415e-07 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3067  50S ribosomal protein L4  68.47 
 
 
206 aa  296  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  6.87824e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3296  50S ribosomal protein L4  69.95 
 
 
206 aa  296  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  1.57529e-09  hitchhiker  7.57839e-05 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3775  50S ribosomal protein L4  68.47 
 
 
206 aa  296  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  7.98525e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3745  50S ribosomal protein L4  68.47 
 
 
206 aa  296  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  4.53819e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1265  50S ribosomal protein L4  66.83 
 
 
206 aa  295  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  5.18808e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2839  50S ribosomal protein L4  67 
 
 
206 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  1.69968e-08  normal  0.198819 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3448  50S ribosomal protein L4  67 
 
 
206 aa  294  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  7.41082e-12  normal  0.0132127 
 
 
 
NC_010084  Bmul_0250  50S ribosomal protein L4  67 
 
 
206 aa  294  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  1.40106e-08  normal  0.147058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3643  50S ribosomal protein L4  66.5 
 
 
206 aa  294  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  1.53267e-09  hitchhiker  2.11598e-11 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3998  50S ribosomal protein L4  65.37 
 
 
206 aa  293  8e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.69649e-06 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3178  50S ribosomal protein L4  67.98 
 
 
206 aa  294  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  1.6876e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0315  50S ribosomal protein L4  66.5 
 
 
206 aa  294  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  4.12641e-11  hitchhiker  0.00861601 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0277  50S ribosomal protein L4  67 
 
 
206 aa  293  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  6.96788e-12  normal  0.0754371 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0328  50S ribosomal protein L4  67 
 
 
206 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  9.30223e-08  normal  0.0206029 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2758  50S ribosomal protein L4  67 
 
 
206 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  1.7353e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0349  50S ribosomal protein L4  67 
 
 
206 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  6.88148e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0268  50S ribosomal protein L4  67 
 
 
206 aa  293  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  1.19907e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3018  50S ribosomal protein L4  68.97 
 
 
206 aa  293  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  2.07388e-06  decreased coverage  0.000710925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3316  50S ribosomal protein L4  67.98 
 
 
206 aa  292  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  2.98046e-12  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0339  50S ribosomal protein L4  64.39 
 
 
206 aa  288  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  1.98449e-06  decreased coverage  0.000274158 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0054  50S ribosomal protein L4  66.01 
 
 
206 aa  287  6e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  7.93849e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4912  50S ribosomal protein L4  64.88 
 
 
206 aa  287  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  1.42333e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0051  50S ribosomal protein L4  64.53 
 
 
206 aa  285  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  6.2417e-14  hitchhiker  3.36643e-25 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0279  50S ribosomal protein L4  63.41 
 
 
206 aa  283  1e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000793566  hitchhiker  1.26953e-09 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0274  50S ribosomal protein L4  63.41 
 
 
206 aa  283  1e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  8.26226e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0392  50S ribosomal protein L4  62.62 
 
 
206 aa  281  4e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  9.56612e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3794  50S ribosomal protein L4  63.9 
 
 
206 aa  281  7e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0257  50S ribosomal protein L4  61.95 
 
 
206 aa  280  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  1.12537e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0204  50S ribosomal protein L4  60.49 
 
 
206 aa  279  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0406  50S ribosomal protein L4  63.05 
 
 
205 aa  273  1e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  1.59199e-08  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0280  50S ribosomal protein L4P  59.02 
 
 
208 aa  255  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  1.53249e-10  hitchhiker  1.73013e-06 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4000  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  234  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  1.85721e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3750  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  234  8e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.24791e-05  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03121  hypothetical protein  57.64 
 
 
201 aa  233  1e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000877437  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3802  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  233  1e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.66287e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0394  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  233  1e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.49214e-06  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3513  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  233  1e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.09628e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3614  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  233  1e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.61283e-05  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0324  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  233  1e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.87067e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0406  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  233  1e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00340494  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03170  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  233  1e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000977912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4642  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  233  1e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120541  normal  0.0370586 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3806  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  233  1e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  1.72532e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3635  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  233  1e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00226471  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3743  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  233  1e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.0176443 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3708  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  233  1e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  0.838559 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3704  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  233  1e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.12699e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3635  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  233  1e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.71014e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0394  ribosomal protein L4/L1e  57.64 
 
 
201 aa  233  1e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.62947e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4543  50S ribosomal protein L4  56.65 
 
 
201 aa  232  2e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  2.61898e-10  hitchhiker  0.00202926 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0232  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  232  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0200  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  232  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  6.34413e-09  hitchhiker  1.66621e-09 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0159  50S ribosomal protein L4  58.13 
 
 
201 aa  232  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.07057e-05  decreased coverage  4.48668e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0195  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  232  4e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00202265  decreased coverage  0.000317476 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3821  50S ribosomal protein L4  57.14 
 
 
201 aa  232  4e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  7.57079e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0200  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  232  4e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  4.25276e-06  unclonable  2.11023e-11 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0284  50S ribosomal protein L4  57.81 
 
 
201 aa  231  7e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.22015e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3914  50S ribosomal protein L4  57.81 
 
 
201 aa  231  7e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.05295e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0585  50S ribosomal protein L4  57.81 
 
 
201 aa  231  7e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  2.07865e-10  normal  0.110437 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0872  50S ribosomal protein L4  57.43 
 
 
201 aa  229  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.299152  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4316  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  229  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  5.85754e-06  unclonable  6.69948e-11 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4169  50S ribosomal protein L4  56.65 
 
 
201 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.70676e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0197  50S ribosomal protein L4  56.65 
 
 
201 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.74855e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0201  50S ribosomal protein L4  56.65 
 
 
201 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.83773e-08  unclonable  8.89639e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0214  50S ribosomal protein L4  57.64 
 
 
201 aa  229  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  3.22212e-06  unclonable  7.55245e-06 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4055  50S ribosomal protein L4  56.65 
 
 
201 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  7.89198e-07  unclonable  6.65609e-12 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0171  50S ribosomal protein L4  56.65 
 
 
201 aa  228  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.51e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3758  50S ribosomal protein L4  56.65 
 
 
201 aa  228  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  8.15073e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3523  50S ribosomal protein L4  57.35 
 
 
201 aa  228  5e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  8.76425e-08  hitchhiker  7.26358e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4689  50S ribosomal protein L4  57.14 
 
 
201 aa  228  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.12006e-07  unclonable  2.21603e-08 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0185  50S ribosomal protein L4  56.65 
 
 
201 aa  227  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.78875e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0149  50S ribosomal protein L4  56.16 
 
 
201 aa  227  9e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  5.10494e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0857  50S ribosomal protein L4  54.68 
 
 
205 aa  225  4e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0060  50S ribosomal protein L4  52.68 
 
 
200 aa  222  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  1.07913e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2173  50S ribosomal protein L4  56.48 
 
 
200 aa  222  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.74601e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0470  50S ribosomal protein L4  55.39 
 
 
201 aa  220  1e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  1.63865e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4275  50S ribosomal protein L4  52.94 
 
 
201 aa  218  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  1.59231e-05  unclonable  4.48849e-12 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00446  50S ribosomal protein L4  53.92 
 
 
201 aa  217  8e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000113118  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0321  50S ribosomal protein L4  55.44 
 
 
200 aa  217  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0789186  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0422  50S ribosomal protein L4  56.57 
 
 
202 aa  213  1e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00655238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001741  LSU ribosomal protein L4p (L1e)  54.4 
 
 
200 aa  213  1e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.16803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0455  50S ribosomal protein L4  51.83 
 
 
200 aa  213  2e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.035261  unclonable  1.91468e-07 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0961  50S ribosomal protein L4  52.22 
 
 
204 aa  213  2e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  3.92469e-07  hitchhiker  1.64794e-06 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0485  50S ribosomal protein L4  51.83 
 
 
200 aa  213  2e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00632251  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0488  50S ribosomal protein L4  51.83 
 
 
200 aa  213  2e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  1.14619e-09  normal  0.070368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4748  50S ribosomal protein L4  51.83 
 
 
200 aa  213  2e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  7.4471e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0490  50S ribosomal protein L4  51.96 
 
 
200 aa  212  3e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  1.09229e-10  normal  0.0102301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3908  50S ribosomal protein L4  52.08 
 
 
200 aa  212  3e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0485  50S ribosomal protein L4  51.96 
 
 
200 aa  211  5e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  2.38586e-06  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0627  ribosomal protein L4  51.31 
 
 
200 aa  211  6e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  6.98865e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>